perl处理文件路径

以前处理文件路径的时候都是自己写正则表达式,而用perl的模块来解决则更加迅速、准确。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-14 15:51
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bioperl处理fasta和fastq序列截取反向互补翻译等等

截取,反向互补,读入,写出,筛选等

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-08 15:30
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Perl读写Excel

生信分析是用的 .xls 文件 大多是文本格式的文件,是可以被Perl读取的,但遇到真的excel文件时,就不行了,这时候就需要使用模块 使用的模块为: Spreadsheet::ParseExcel Spreadsheet::Writ...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-01 13:59
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perl 读取文件中的科学计数数字

Perl读取文件中的科学计数法数字是是以字符串读取的,需要将其转化为小数,方法如下 use Math::BigFloat;my  $i = new Math::BigFloat '1.931533e-01'; 这里用到了Math::BigFloat这个包,就...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-01 13:11
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perl对文件夹处理

用perl批量处理文件夹下所有文件 opendir()获取目录权柄;readdir()读取目录下文件 #!/usr/bin/perl -w $dirname = "/tmp";         #指定一个目录 opendir ( DIR, $dirname ) || die...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-24 16:15
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Perl去除一个数组中的重复元素

Perl去除一个数组中的重复元素

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-09 16:32
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Perl提取染色体序列指定范围的基因序列

Perl提取指定位置的基因序列用到 substr 函数,用法: $gene = substr( $fasta,$start-1, $end - $start+1); 其中$fasta是总的序列;$start是提取序列的开始位置,由于Perl字符串是从0计数的...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-09 16:27
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怎么用Perl脚本得到反向互补序列

怎么用Perl脚本得到反向互补序列

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-09 15:51
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