基于perl 提取基因家族内的串联重复基因对

基于perl 提取基因家族内的串联重复基因对

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• Daitoue
• 发布于 2018-08-31 10:27
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perl 中 grep 的使用

perl 中 grep 的使用

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• 安生水
• 发布于 2018-08-17 12:10
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perl 中 $#ARGV 是什么意思

perl 中 $#ARGV 是什么意思

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• 安生水
• 发布于 2018-08-17 10:37
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perl中对数组字符串取交集，并集，差集包

Array::Utils ，perl中对两个数据取交集，并集 差集等等，union，intersect，diff等操作

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• omicsgene
• 发布于 2018-08-06 17:51
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perl中读取和写出Excel的包，xls，和xlsx

介绍两个perl中的包，分别可以读取Excel的文件，包括2003 的xls文件，和2007的xlsx的文件。Spreadsheet::ParseExcel; Spreadsheet::ParseXLSX;

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• omicsgene
• 发布于 2018-08-05 16:59
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miRNA与靶基因相关性作图

miRNA与靶基因相关性作图

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• 安生水
• 发布于 2018-08-03 13:02
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提取miRNA前后500bp序列

在没有位置信息时，提取miRNA前后500bp的序列

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• 安生水
• 发布于 2018-08-03 11:44
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perl脚本批量生成反向互补序列

有时候我们需要得到序列的反向互补序列，可以用下面的脚本来批量处理序列。

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• 安生水
• 发布于 2018-08-02 17:14
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从MEGA进化树分析结果nwk文件提取基因ID

从nwk文件中提取基因ID

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• 安生水
• 发布于 2018-07-27 14:38
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2维韦恩图各部分基因上下调数量统计

2维韦恩图各部分基因上下调数量统计

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• 安生水
• 发布于 2018-07-27 11:34
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提取指定基因的fasta序列

简便好用的序列提取的perl脚本

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• 安生水
• 发布于 2018-07-27 09:31
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perl中的正则表达式

perl中的正则表达式

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• omicsgene
• 发布于 2018-07-20 15:00
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从Windows粘贴到linux的内容行尾会有东西？

将Windows中该文件的内容粘贴复制到linux文件中，用perl读取并保存到哈希中，然后读取另一文件的第一行，判断他第一列的内容是否在上一个文件中存在，结果总是不存在，然而明明就在啊，怎么会不存在呢，一遍遍检查代码也找不到问题。到底为什么呢？

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• 安生水
• 发布于 2018-07-13 15:14
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perl 从数组随机抽取元素

perl中如何随机抽取数组中的一个元素。

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• 安生水
• 发布于 2018-07-13 13:51
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ActivePerl自带的PPM软件无响应

ActivePerl安装perl模块

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• omicsgene
• 发布于 2018-07-09 16:41
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perl语言——正则表达式

正则表达式(regular expression)描述了一种字符串匹配的模式，可以用来检查一个串是否含有某种子串、将匹配的子串做替换或者从某个串中取出符合某个条件的子串等。 Perl语言的正则表达式功能非...

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• 安生水
• 发布于 2018-06-29 14:32
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提取基因组所有基因的启动子序列

有时候们会需要基因的启动子序列，这里有脚本可以提取基因组所有基因的启动子序列。

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• 安生水
• 发布于 2018-06-29 12:56
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SNP2CAPS使用

SNP2CAPS可将SNP转换为CAPS标记，其具体用法： perl SNP2CAPS.pl   chr5D:9950377.fa_1    link_gcg    AanI,AarI,AasI,AatII,Aba6411II,AbaB8342IV,AbaCIII   > chr5D:9950377.txt 其中...

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• 安生水
• 发布于 2018-06-22 15:44
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merged.gtf 合并同一转录本的exon位置

在merged.gtf文件中有所有外显子的信息，下面的脚本可根据此文件提取转录本的所有外显子位置信息。 merged.gtf文件实例： Chr00   Cufflinks       exon    37990   38333   .       +      ...

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• 安生水
• 发布于 2018-06-22 15:09
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perl 中glob函数

perl中通过文件操作符glob提供相当于shell中的指定多个文件的“通配符”语法功能，文件操作符glob将返回与所指定的glob文件模式相匹配的所有文件的list。

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• 安生水
• 发布于 2018-06-22 14:29
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