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泛基因家族分析-SV和表达量

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泛基因家族分析-SV和表达量

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泛基因家族分析-SV和表达量

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泛基因家族分析-SV和基因表达量

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泛基因家族分析-SV和基因表达量

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泛基因组分析教程中的env.sh文件运行自己相应物种时，里面的命令行是不是要进行修改如下图所示

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泛基因组分析，磁盘配额不足

  • Yang 2025-07-26 16:31
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泛基因筛选最长转录本时出现问题

  • Yang 2025-07-03 22:25
2 解决

基因ID

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单细胞测序的细胞通讯分析 cellchat

  • Zzz 2025-04-28 16:55
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文件夹权限受限，无法删除

  • Zzz 2025-04-28 10:51
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如何合并两个单细胞测序中的两个子集？

  • Zzz 2025-04-26 22:41
0 回答

使用monocle3进行轨迹分析报错

  • Zzz 2025-04-26 17:43
1 回答

使用monocle2进行轨迹分析报错

  • Zzz 2025-04-26 17:13
1 回答

使用单细胞转录组课程中的代码进行GSVA分析时，找不到所关注的通？

  • Zzz 2025-04-26 16:19
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从https://ricerc.sicau.edu.cn/下载的基因组和gff文件进行水稻泛基因分析出

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在进行GWAS的LDBlock可视化中，在Win11本地的Docker执行LDBlockShow -Cutline 7 -InVCF $vcf -OutPut LD.p \ -Region Chr1:36000000-37000000 -OutPng -SeleVar 2 -InGWAS ld.pvalue.txt -PointSize 0.8命令时，程序居然报错UnKnow argument -PointSize，请问这是怎么回事呢，如何解决呢？请组学大讲堂的老师麻烦回答一下！谢谢！

  • John 2025-03-12 16:57
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GWAS分析发现的问题如下：第一，过滤水稻vcf的RawData时（群体有176份），我选择的minGQ值为20（同时要移除InDel），结果得出过滤出来的SNPs数量不足1000，但是我查过一些资料，GQ值如果群体数量较少值不得小于20。请问遇到这种情况如何处理，可否将最小GQ按照课程的脚本设置为0呢。 第二，你们的GWAS课程提供的计算BLUP的脚本是否在不同物种之间通用 第三，做GWAS时，基因型填充对后续的分析有什么意义。 第四，你们GWAS课程有没有计算遗传力相关的脚本。

  • John 2025-03-12 15:37
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我在win11本地GWAS分析时，进行plink。结果报错了（Segmentation fault （Core dumped）），请问各位如何解决

  • John 2025-03-12 15:36
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采用你们课程的：Rscript $scriptdir/gwas_manhattan_plot.r 以及Rscript $scriptdir/qq_plot.r制作Manhattan图和QQ图后，Manhattan图最高的SNP仅仅显示半圆（如下图），请问如何修复（就是修改可视化Manhattan图的纵坐标）

  • John 2025-03-12 15:35