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10 动植物泛基因组分析：03.gene_family_pav 分析自己的数据时，运行命令Rscript $scriptsdir/core_pan_gene_curve.r -i Orthogroups_PAV.tsv --prefix core_pan_curve 出现以下报错信息

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10 LTR注释结果

  • 2024-04-01 20:36
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5 进行基因注释过程中运行这个脚本perl $scriptsdir/pasa_extract_best_candidate_geneModels.pl $DATABASE.assemblies.fasta.transdecoder.genome.gff3 $DATABASE.assemblies.fasta.transdecoder.cds 3 900 0.60 0.95 0.95 > best_candidates.gff3出现错误。希望老师解答，谢谢

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5 跟着课程跑了一遍BSA的结果，但发现输出图片的横坐标是固定的，只有40Mb左右，而我自己的数据中染色体有100Mb左右，输入后会报错，想问一下有没有办法调整这个宽度？

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5 请问老师有基础教学肿瘤二代测序生信分析课程吗？

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10 老师您好，请问BSA分析，如果取到不那么极端的性状个体混池，会对后续的分析有很大的影响吗？具体影响是什么？或者为什么没有很大的影响?

  • 2022-02-25 09:21
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10 老师您好，我购买了扩增子的课程，在做分析时遇到如下问题：我是混样后侧的序列，结果只有一个fasta格式的序列结果。但是跑课程中的代码是把每个fasta文件加序列号改成符合qiime的格式再合并。而我一开始就是合并在一起的文件，想问有什么办法把合在一起的文件拆分成多个fasta文件吗？或是直接在合并好的文件里直接加序列号从而符合qiime格式吗？谢谢

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20 老师您好，请问，我本来有11个样本，按课程里面的代码输入后，为什么少了两列样本呀？到底是哪里有问题呀啊啊啊！

  • 2021-02-19 17:35
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5 关于基因芯片affy包rma标准化

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5 你好，请问在biolinux里面运行meme搜索蛋白的motif，nbs_motif文件夹里面只有txt格式的文件，没有xml以及其他文件，这是什么原因呢

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5 老师，请问做Conet 构建的时候只有两个样本，但是有多个环境因子能做图吗？我导入数据报错了“After filtering, less than 3 columns remain in the input matrix!”请问该如何解决呢？

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10 学习中遇见的问题

  • 2019-02-11 15:17
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5 基因家族分析课程中，get_gene_weizhi.pl脚本运行后导出文件为空

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5 TFBS文件没有包含所有的转录因子

  • ysyc 2018-10-14 21:27
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5 老师，我在学习基因家族视频，用perl脚本预测基因顺式作用元件时出现了问题，提取不了位置信息

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5 TCGA-基因差异表达分析课程中您写的perl脚本如何运行？