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60 求教各位老师，做大麦基因家族分析构建系统进化树时，拟南芥家族成员分到了单独一支，和大麦成员没法做比较。这种情况怎么解决呀

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3 在基因家族分析的课程里，提取结构域序列，WRKY基因家族当时以提取第一个结构域序列为例，两个结构域都是WRKY DNA -binding domain，为什么要提取第一个结构域呢，我想知道怎末确定自己要提取哪个结构域序列？希望老师解疑惑

  • : ) 2022-11-08 21:47
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hmm搜索失败，已检查hmm文件，并重新建hmm模型，还是报错。

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motif

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blast建库,DNA序列,all vs all 比对后输出文件0kb

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有几个不同品种的文件夹怎么进行基因鉴定？是单独鉴定还是合并呢？合并是要怎么合呢？

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关于基因结构分析失败的原因分析

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10 【MCScanX】 tandem文件中【串联重复】基因对，若其中一个基因A属于已鉴定基因家族，另一个基因B由于结构域不完全被剔除在外。请问在circos绘制串联重复图时，还要保留A基因吗？

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请问虚拟机进不去咋办

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老师您好，我做藻的基因家族分析，构建进化树的过程中遇到了mega软件比对NJ法不能够完全比对成功，显示总是有一次错误，进化树显示不完全，更换其他方法后，进化树也都显示不完全，请问这样的有什么解决办法嘛

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基因家族成员系统发育树

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3 建立进化树

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老师，我共线性出的图没红线，这是怎么回事啊

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3 建立进化树

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20 我使用OrthoMCL处理blast产生的结orthomclBlastParser blastresult compliantFasta > similarSequences.txt，出现了问题，不知道怎么解决

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5 鉴定同源基因的orthoMCL和OrthoFinder在结果上有什么区别嘛？谢谢各位老师啦~

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你好，家族分析时要求把序列和进化树上传到tree base数据库中，有上传过的吗？

  • we 2021-07-26 16:21
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无法下载MCScanX-transposed

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老师，我在做共线性的时候遇到下面的问题，该如何解决

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去冗余的同时，提取前两列的信息

  • lkl 2021-05-13 16:05