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老师您好，单倍型分析的图是这样的，我关注的是蓝色框起来的标记，这个snp是否处于一个高度连锁的区域，属于左边的block还是右边的block呢

  • 2024-12-08 23:43
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请问单倍型分析时遇到这个问题该怎么处理

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老师您好，针对这个问题https://www.omicsclass.com/question/7725。你们提到：你这个数据里面是不是P值有0的情况，取了对数就无穷大了，导致出问题。但是，我发现里面没有P值为0的情况，那是不是脚本gwas_manhattan_plot.r有问题呢？需要修改gwas_manhattan_plot.r脚本的什么地方才可以解决顶部只能画半圆的问题呢？还有，我发现P-Value的原始文件有NaN的情况，是什么原因呢？是否对GWAS有影响呢？

  • John 2025-03-18 15:15
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请问老师单倍型分析结果中，我怎样确定block区间，如下图。请老师解答哪些标记划分为block1，哪些标记划为block2

  • 2025-02-23 21:38
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请问单倍型分析一直显示错误怎么办

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请问单倍型分析时遇到这个报错应该怎么解决

  • 2025-01-15 13:57
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全基因组关联分析GWAS教程中的beagle填充问题

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老师，二代测序数据可以GWAS分析嘛？植物上做GWAS的话测序深度5X可以嘛？

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请问这样的QQ图说明GWAS结果是否合适的呢？

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老师，我有两个分级性状，需要进行BLUP嘛

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GWAS分析绘制QQ图时，Observed值与Expected值相差较大

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tassel导入表型数据和Q文件，一直报错格式有误