Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 进行转录本与基因组的比对
Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 进行转录本与基因组的比对
- 0
- 0
- microRNA
- 发布于 2018-08-10 15:40
- 阅读 ( 6067 )
microRNA
安生水
R 语言colors()657种颜色
R进行绘图多会涉及颜色搭配问题，利用colors()可以获得R种的657种颜色名称。 head(colors(),20) [1] "white" "aliceblue" "antiquewhite" "antiquewhite1" [5] "antiquewhite2" "...
- 0
- 0
- Daitoue
- 发布于 2018-08-10 14:29
- 阅读 ( 13305 )
Daitoue
Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 进行转录本的合并
Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 进行转录本的合并
- 0
- 0
- microRNA
- 发布于 2018-08-10 14:03
- 阅读 ( 3685 )
MA plot 绘图计算公式
MA图主要应用在基因组数据可视化方面，实现数据分布情况的展示。早期主要应用于DNA芯片数据，现在常用于高通量测序数据中基因差异表达分析结果的展示。 其计算公式如下： M一般做Y轴...
- 0
- 0
- Daitoue
- 发布于 2018-08-10 13:20
- 阅读 ( 10469 )
Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 融合基因的分析
Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 融合基因的分析
- 0
- 0
- microRNA
- 发布于 2018-08-09 14:55
- 阅读 ( 4255 )
ggplot2主题theme参数
ggplot2绘图theme参数设置 theme(line, rect, text, title, aspect.ratio, axis.title, axis.title.x, axis.title.x.top, axis.title.y, axis.title.y.right, axis.text, axis.text.x, axis....
- 0
- 0
- Daitoue
- 发布于 2018-08-08 17:50
- 阅读 ( 6547 )
perl中对数组字符串取交集，并集，差集包
Array::Utils ，perl中对两个数据取交集，并集 差集等等，union，intersect，diff等操作
- 0
- 0
- omicsgene
- 发布于 2018-08-06 17:51
- 阅读 ( 4714 )
omicsgene
perl中读取和写出Excel的包，xls，和xlsx
介绍两个perl中的包，分别可以读取Excel的文件，包括2003 的xls文件，和2007的xlsx的文件。Spreadsheet::ParseExcel; Spreadsheet::ParseXLSX;
- 0
- 0
- omicsgene
- 发布于 2018-08-05 16:59
- 阅读 ( 11951 )
在线进化树美化网站-iTQL
除了利用Figtree等对进化树进行美化之外：两分钟做一张让人羡慕的系统进化树图！也有不少在线工具可以实现这项工作，譬如iTQL:http://itol.embl.de/ 进入网站主页之后，选择Upload进入数据上...
- 5
- 0
- Daitoue
- 发布于 2018-08-03 10:50
- 阅读 ( 13982 )
Mapman对表达数据进行venn绘制
Mapman除了对基因进行注释及表达数据可视化之外，还可以利用软件之际对多样品数据中注释到Mapmen通路的数据进行venn图绘制。主要操作过程如下： 从Experiments导入表达数据,具体参考文章：植物...
- 0
- 0
- Daitoue
- 发布于 2018-08-02 14:01
- 阅读 ( 3315 )
TCGAbiolinks 下载临床数据，警惕有多次随访数据
TCGAbiolinks 下载临床数据，警惕有多次随访数据
- 0
- 0
- microRNA
- 发布于 2018-08-01 14:04
- 阅读 ( 3539 )
linux 从文件中随机抽取部分数据
如何从某一个文本文件中随机抽取一部分数据。譬如右下方这样的基因表达量数据的统计文件ref_trans_full_table.xls目标是由此文件中随机抽取一部分数据。 可以利用shuf获取随机数据，譬如随机...
- 0
- 0
- Daitoue
- 发布于 2018-07-31 17:04
- 阅读 ( 4470 )
