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GATK 很慢，怎样分染色体CALL 变异

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正在运行命令的docker因为断网后重启还可以继续运行上次的代码吗？

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Hic挂载时 K值选择

  • _He. 2025-04-23 08:48
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braker注释结果有问题

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老师你好，我用全长序列进行比对构建进化树时，发现许多序列的长度长短不一，这样可以用吗？ 感谢老师答疑

  • 2025-04-03 10:41
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老师，我正在做泛基因家族分析的系统发育树构建，构树过程中，出现以下的过程及警告，请老师帮忙看看是否正常，这些重新序列的编号是否有影响（序列对其修剪后有重复名称已去除），以及我下面的系统发育树这么多是否正常，还是需要筛掉一些？

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老师，您好， 我想问一下选择清除分析fst和pi结合的图的曲线为什么变细了？ 我用红色框线圈起来了

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老师，我正在做泛基因家族分析的结构变异与基因注释部分，出现一些错误

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请问pfam 模型下载选择那个是？ hmm后缀的文件还是seed 文件？

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我在做T2T，docker下载T2T镜像错误

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宏基因组数据预处理问题

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lefse分析细节

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服务器超过5个线程，被killed。请问怎么使用名单规定线程？下面命令如何修改规定线程。

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Error correction and assembling warnings: * 0:12:28.935 6768M / 13G WARN General (kmer_coverage_model.cpp : 327) Valley value was estimated improperly, reset to 16

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Error correction and assembling warnings: * 0:12:28.935 6768M / 13G WARN General (kmer_coverage_model.cpp : 327) Valley value was estimated improperly, reset to 16

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老师，我研究的植物有人已经构建了泛基因组，用的从头组装比对的方式，我想问一下，如何利用他的数据做我的研究，我可以添加几个自己的物种进去吗，请老师给个研究思路

  • Oho 2025-03-27 10:25
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老师您好，我想问一下，一个鉴定出来的基因ID它的CDS序列开头是TAC而不是ATG,那这个基因可以保留吗

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请问老师，为什么显示找不到文件呢，已经尝试过重新传输文件

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您好，请问您paircoil2安装问题解决了吗，我安装也出现了和您类似的问题，我也按照那个文件要求把配置文件放在家目录下，但是仍然命令使用不了，网上实在搜索不到相关信息，只能请问您了，望回复

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宏基因组分析老师上课的内容。