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SV与家族基因的保守结构域分析

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基因家族数据准备#提取cds序列#提取pep序列

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泛基因家族分析之基因家族成员选择压力分析

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泛基因家族分析，系统发育树构建

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10 对gff文件进行处理，保留注释信息中能编码蛋白的基因。得到的结果文件‘.protein_coding.gff3’是空的，应该怎么办。所有品系都出现了这个问题。

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泛基因家族-热图

2 解决

10 成功启动镜像，进入容器，把课程资料下载到本地并解压缩，还是找不到课程资料

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存在缺失分析

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15 数据准备 检查变量对应有问题

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泛基因家族分析

2 解决

10 成功启动镜像，进入容器，把课程资料下载到本地并解压缩，为什么找不到课程资料

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存在缺失分析

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10 你好，我想请问一下。像在这篇土豆的文章里，ARF家族成员从1-28的编号，这个命名规则是怎样的啊？是作者人工定义的，但总有个编号排序的规则？

  • wsy 2026-05-19 11:36
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泛基因家族SV分析-VCF文件

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关于保守结构域选择几个的问题

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泛基因家族分析的数据准备的里面有一个加载全局变量env.sh,请问这个有什么作用？里面改没改这个Ref=B73为自己的物种有什么区别呢，修改了要不要加这个基因组的具体路径？

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泛基因家族分析，核心基因等数量统计

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泛基因组

3 解决

20 将基因组文件和gff文件批量链接到当前文件夹时，文件名出现问号，下一步对gff文件进行处理（保留蛋白编码基因）报错，应该怎么办

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泛基因家族分析数据准备里面，运行命令保留最长转录本结果都会报错，说是找不到文件，但文件存在在data目录下， ./.gff3.gz does not exist，Please verify the input file name/path