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20 从https://ricerc.sicau.edu.cn/下载的基因组和gff文件进行水稻泛基因分析，无法获取longest_isoform.gff3文件

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老师，以下是我的基因家族列表，基因组ID文件，基因家族泛基因列表，以及独有家族基因，下一步要做统计家族成员数量、排序及存在缺失分析，请老师帮忙看看，由于我的基因组名称中C01-C09，L01-L09,Q01-109还有另xiaomi等基因组名称与基因id命名对不上，该怎么修改，以上我没有自己修改内部任何内容

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老师，我正在做泛基因家族存在缺失分析作图作图这一步，前面由于ID.txt与基因家族列表对应不上，将ID.txt文件按照基因家族列表前缀进行了修改，并排序，但是得到的PAV_draw.list和PAV_gene.list,不确定对不对，且作不出图

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老师，我在做泛基因家族成员存在缺失分析时，做统计各个样本家族成员数量，及根据数量对基因组进行排序时候，由于我原始得到的maize.WRKYgene.list文件里的基因名称，和ID.txt文件里的基因组名称无法链接，有很多基因组无法识别出成员数量，（也就是因为这一步，我才把我上一个问题提的把基因名称及ID名称改掉了），请问怎么修改指令？

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基因家族分析时，提取cds与pep序列报错显示 no sequence

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泛基因家族分析-数据准备

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5 如何自己制作泛基因组的pangene.list呢

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3 是否可以将同源聚类的结果命名成TPS1/2/3

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omicsclass/pan-genome:v1.1镜像OrthoFinder.py报错

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老师您好！我是组学大讲堂基因家族分析课程的学生，请问现在omicsclass的镜像是不能拉取了吗，里面的gene-family镜像是不是删除了，怎么找不到了。

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泛基因家族分析cds提取出现killed

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hmmsearch 关于参数--cut_tc设置

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hmmsearch出现Segmentation fault (core dumped)

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参考基因组这个docker怎么练到filezilla，为什么我没法安装openssh或者filezilla，我应该怎么做

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泛基因，SV ，VCF文件格式为4.2 ，没有课程里要求的SUPP_VEC和SVLEN信息，怎么改？会影响后面分析吧？

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搜集的gff3文件；第一列不同，有的是chr，有的是id；这个影响吗？

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5 泛基因家族docker报错

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老师，我在做饭基因家族分析，我搜集的基因组的gff3文件，第一列有的是chr有的是基因id，这个会影响后续结果嘛？

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3 关于泛基因组的pangene.list

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5 docker打不开镜像