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组学大讲堂QIIME2(v1.5)镜像更新说明

对于qiiem2更新细节的一些描述

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  • xun
  • 发布于 2023-01-06 13:26
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ssh-keygen和ssh-copy-id实现免密登录远程主机

ssh-keygen和ssh-copy-id实现免密登录远程主机

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-01-04 13:38
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Rocky Linux安装 时报错： DNF error

Rocky Linux安装 时报错： DNF error

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  • 安生水
  • 发布于 2023-01-03 14:03
  • 阅读 ( 4395 )

基因组重复序列分类

重复序列是指基因组中频繁出现的相同或对称的DNA片段，在植物基因组中占有很大比重，根据重复序列在植物基因组中的组织方式不同进行分类。

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  • 星莓
  • 发布于 2022-12-29 17:42
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错误：perl: warning: Please check that your locale settings: LANGUAGE = (unset), LC_ALL = (unset), LC_CTYPE = "UTF-8", LANG = "en_US.UTF-8"

计算机连接服务器并使用perl的时候，可能会报上述错误 这个时候，你需要在主机上的 ~/.bashrc 或 ~/.bash_profile 文件加上下面的参数， # Setting for the new UTF-8 terminal support in...

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  • xun
  • 发布于 2022-12-29 14:10
  • 阅读 ( 2484 )

linux清屏的几种方式

linux清屏的三种方式

根据GFF文件提取基因组中基因的蛋白，CDS，CDNA序列

https://github.com/TransDecoder/TransDecoder

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  • omicsgene
  • 发布于 2022-12-28 11:52
  • 阅读 ( 4121 )

使用orthomcl分析同源基因时的 mysql数据库操作

使用orthomcl分析同源基因时的 mysql数据库操作

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  • 安生水
  • 发布于 2022-12-26 14:48
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BWA比对及Samtools提取mapped reads

筛选出能比对到参考序列的reads，形成新的fastq文件

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  • 星莓
  • 发布于 2022-12-20 14:27
  • 阅读 ( 9863 )

O2PLS-DA分析

两组学数据的正交偏最小二乘法判别分析（2-way orthogonal Partial Least Square with Discriminant Analysis ） O2PLS 模型用于两个数据组间的整合分析，包括系统生物学组学间关联、分子调控...

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  • rzx
  • 发布于 2022-12-19 14:20
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ggforestplot error: Error in assertAndRetrieveTidyValue(x, mean) : argument "x" is missing, with no default

使用ggforestplot绘制森林图时，有时候会报如标题所示的错误 实际上，这不一定是因为缺失参数，也有可能是因为加载了forestplot包，这两者的语法存在交叉，所以如果同时加载，就可能出现错误，...

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  • xun
  • 发布于 2022-12-19 13:42
  • 阅读 ( 2276 )

linux 常用的解压命令

linux 常用的解压命令

GenomicsDBImport 的多样本变异检测

GenomicsDBImport 的多样本变异检测

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  • 安生水
  • 发布于 2022-12-19 10:59
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ERROR 1290 (HY000): The MySQL server is running with the --skip-grant-tables 解决方法

ERROR 1290 (HY000): The MySQL server is running with the --skip-grant-tables 解决方法

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  • 安生水
  • 发布于 2022-12-12 14:49
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pfam数据库被合并之后，还有很多数据库可以进行结构域的查询

pfam数据库被合并之后，还有很多数据库可以进行结构域的查询

零假设与备择假设

零假设（null hypothesis），统计学术语，又称原假设，指进行统计检验时预先建立的假设，这个假设一般是未进行实验之前最保守和有意推翻的假设，而之后实验的目的一般是希望证明其假设错误。 零...

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  • rzx
  • 发布于 2022-12-09 15:23
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repeatMasker 得到的out文件转换成gff文件，可以用bedtools对基因组进行重复区屏蔽

repeatMasker 得到的out文件转换成gff文件，可以用bedtools对基因组进行重复区屏蔽

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  • omicsgene
  • 发布于 2022-12-07 10:13
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pip报错

出现报错WARNING: Running pip as the 'root' user can result in broken permissions and conflicting behaviour with the system package manager. It is recommended to use a virtual envir...

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  • xun
  • 发布于 2022-12-05 16:42
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mysql启动时报错：error while loading shared libraries: libncurses.so.5: cannot open shared object file

mysql启动时报错

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  • 安生水
  • 发布于 2022-12-05 14:14
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MySQL报错：ERROR 2002 (HY000): Can't connect to local MySQL server through socket '/tmp/mysql.sock'

MySQL报错：ERROR 2002 (HY000)

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  • 安生水
  • 发布于 2022-12-05 14:09
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