bedtools 对bed 文件进行排序

bedtools 对bed 文件进行排序

bedtools sort 命令可以按照染色体或者其他标准进行排序,默认情况下,bedtools sort 命令首先按照染色体进行升序排列,然后按照起始位置再进行升序排列。


用法如下:

#cat  a.bed
chr1    1       100
chr1    200     400
chr2    1       100
chr1    110     200
chr3    3000    4000
#bedtools sort -i A.bed
chr1    1       100
chr1    110     200
chr1    200     400
chr2    1       100
chr3    3000    4000


  • 发表于 2023-06-05 11:35
  • 阅读 ( 1107 )
  • 分类:软件工具

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安生水
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