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具有两个结构域的基因家族的分析

建议不用合并分析,以NBS-ARC结构域为准,才是NBS基因,其他结构域只是附带的结构域,可有可无。但是对于基因分类有用。 自己的数据自己分析,关键是自己得有分析思路;

回答于 2019-10-25 12:42

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GFF文件解释

GFF文件说明见:https://www.omicsclass.com/article/306

回答于 2019-10-25 12:41

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大麦基因家族分析时,进行基因结构分析时,hmmer提不到外显子gff...

注意GFF里面的ID,脚本去识别的时候是要完全一样才行,注意是=号和分号;之间的都是ID,例如:

回答于 2019-10-24 17:30

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老师您好,我有个问题想请教您,就是以您看的文献来说,您觉得有...

这个CDPK激酶我了解的不多,你需要再多多查阅相关文献

回答于 2019-10-24 10:29

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有个问题想请教一下大家,从数据库中下载的原始数据的gff文件,...

大部分是通过一些软件根据基因的特点预测出来的;例如: 参考文献:https://www.nature.com/articles/s41559-017-0120

回答于 2019-10-24 10:28

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您好您看我挂机了为什么还是打不开这个TXT啊

你的共享目录没有写的权限,如果没有勾只读分配,建议你重启试试;

回答于 2019-10-23 16:20

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Tbtool中Quick Mscanx Wrapper使用的时候总是得不到结果

没用过tbtools 做共线性分析建议使用MCScanX之间分析:https://www.omicsclass.com/article/275 或者观看基因家族分析课程,里面有详细的使用教程: 《基因家族分析实操课程》

回答于 2019-10-23 12:01

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gzip: Phaseolus_vulgaris.PhaVulg1_0.45.gff3: Protocol error

看看文件是否下载完整,重新下载文件吧;

回答于 2019-10-23 11:59

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Failed to open tabular per-dom output file zf-C2H2.txt for w...

当前目录没有写的权限,挂载共享目录的时候不要勾选只读分配; https://www.omicsclass.com/article/260

回答于 2019-10-22 14:43

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想问问进化树外面的各个亚族的环是怎么做的,第二就是树枝末端的...

可以使用evolview在线工具完成:https://www.omicsclass.com/article/671

回答于 2019-10-22 09:50