omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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VCF文件按照指定的染色体排序

后面要跟这个文件的路径：picard.jar

回答于 21小时前

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二代转录组多个样本直接合并即可：https://www.omicsclass.com/question/6317 三代数据需要组装成完整的全长转录本（full length）序列到est.fa 文件里面：est=$datadir/est.fa #该物种完整的est 基因表达序列

回答于 5天前

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基因家族数量太少，可以多个物种放在一起分析：https://www.omicsclass.com/article/760

回答于 5天前

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磁盘存储空间满了，删除一些不要的中间文件，节约存储；

回答于 2025-09-30 11:48

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重启一下Rstudio试试：https://www.omicsclass.com/article/2080

回答于 2025-09-28 18:56

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dockerhub 国内上不了，有购买我们课程可以联系客服处理：点击联系客服

回答于 2025-09-26 21:07

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mycelltype 这个分组的细胞只有一种细胞类型，你检查你的leaf.added.celltype.qs 的metadata文件看看这一列是不是只有一组；打开R脚本cell_trajectory_monocle3.r，把这些行删除，或者行前面加上 # 号，不运行这个绘图试试：

回答于 2025-09-25 09:24

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基因是在细胞中表达，不明白你：提取TIP这个maker基因是什么意思？是想提取TIP高表达的细胞吗？你可以这样： Rscript $scripts/subset_seurat_obj.r --rds cluster3.qs --subset 'TIP >1' -p cluster3.TIP

回答于 2025-09-25 09:12

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回答于 2025-09-24 09:24

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回答于 2025-09-24 09:22