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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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docker启动报错

镜像名字写错了:

回答于 2小时前

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Error response from daemon: Get "https://index.docker.io/v1/...

dockerhub 国内上不了,有购买我们课程可以联系客服处理:点击联系客服

回答于 1天前

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docker load -i /mnt/data/home/liangziyang/metagenomics-data/...

docker 加载镜像默认放在家目录下,你的家目录满了吧; df -h #查看存储

回答于 1天前

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我想把vcf文件转换为hapmap文件,一直跳出来这个提示,是什么原...

命令写错了,perl 后面根perl脚本,你后面根vcf文件,不对的;

回答于 1天前

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单细胞测序的细胞通讯分析

看看这个问题:https://www.omicsclass.com/question/7704 cellchat的bug,你用数字代替细胞分组

回答于 1天前

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文件夹权限受限,无法删除

试试加 -f参数试试; rm -rf shells 更改所有者: chown -R us019:us019 shells

回答于 1天前

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使用monocle3进行轨迹分析报错

你的轨迹可能只有一个,导致报错,打开那个R脚本这里修改一下:

回答于 2天前

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单细胞测序数据两个子集合并

下面是手动修改列名的R代码,你自己可以运行修改一下: # 加载必要的包library(Seurat)library(dplyr)## 1. 创建示例Seurat对象(如果已有数据可跳过此步)# 使用Seurat内置数据集seurat_obj <- readRDS("subsetCD8.reanalysis.rds")# 查看原始metadata列名cat("原始metadata列名:\n")print(colnames(seurat_obj@meta.d...

回答于 2天前

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使用单细胞转录组课程中的代码进行GSVA分析时,找不到所关注的通...

内置的 基因集数据库用的R包是这个:msigdbr 说明:https://igordot.github.io/msigdbr/articles/msigdbr-intro.html 常见基因集: gs_catgs_subcatnum_genesetsC1299C2CGP3384C2CP29C2CP:BIOCARTA292C2CP:KEGG186C2CP:PID196C2CP:REACTOME1615C2CP:WIKIPATHWAYS664C3MIR:MIRDB2377C3MIR:MIR_Legacy221C3TFT:GTRD518C3T...

回答于 3天前

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如何合并两个单细胞测序中的两个子集?

还是用之前的脚本合并:示例脚本在: 03.seurat_cluster.sh #合并数据Rscript $scripts/merge_seurat_obj.r -i CD4.added.celltype.rds CD8.added.celltype.rds   -p all.sample.merged

回答于 3天前