qs文件应该是 seurat 对象,不能由你提供的表格文件生成; qs文件包括每个细胞的基因表达数据,及细胞信息(你的tsv文件) 不知道你的qs文件如何生成的,你把命令发我看一下;关于报错 批次分组名称需要和你qs对应的metadata文件里面的列名一致,我看你tsv文件里面没有stim列名分组:
回答于 13小时前
下面是解释 类别常见取值含义与影响外显子区 (编码)nonsynonymous SNV非同义突变:单个碱基改变导致氨基酸改变(错义突变)。synonymous SNV同义突变:碱基改变但氨基酸未改变。stopgain获得终止密码子:突变导致提前出现终止信号,产生截短蛋白。stoploss失去终止密码子:终止密码子突变,蛋白翻译会延长。frameshi...
回答于 2026-06-01 16:57
你要核对的是 : GFF文件格式没问题,以及核对第一列染色体ID和基因组文件染色体ID是否一致;如果核对没有问题,你把当前文件夹文件清空之后再重新运行命令,AGAT检测到有输出文件存在会退出;
回答于 2026-05-01 06:13
出现乱码用专业的文本编辑工具,不要用记事本编辑id.txt :https://www.omicsclass.com/article/395
回答于 2026-04-28 14:50
你先运行 linux命令:free -h 看看计算机资源1.如果是在我们组学大讲堂云服务器运行,你说说你云服务器配置 2.如果是自己电脑运行,看看配置的 磁盘是存储。 内存指的是运行内存,一般都是内存不够,你降到--localcores 1 试试, spaceranger推荐内存128G:https://www.10xgenomics.com/support/software/space-...
回答于 2026-04-27 17:46
云服务器上的数据和你本地电脑数据没关系; 你需要把本地电脑数据上传到云服务器才行;服务器上传数据,看看登录时显示的使用手册链接有详细说明;
回答于 2026-04-02 11:35