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LDBlockShow -Cutline 7 -InVCF $vcf -OutPut LD.p \ -Reg...
PDF图片文件可以用 Adobe illustrate 打开手动编辑一下文字大小；
回答于 2025-07-02 11:22
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请问个人怎么才能下载到TCGA的组学，临床和WSI影像数据？
TCGA处理之后的组学数据和临床信息个人是可以直接下载的，但是影像数据可能需要申请才行； 1. 基因组数据 mRNA表达数据（RNA-Seq、microarray）miRNA表达数据DNA甲基化数据蛋白质表达数据（如RPPA）基因拷贝数变异（CNV）突变数据（Mutation calls，SNV等） 2. 临床数据 患者的基本信息（年龄、性别、种族等）肿瘤分期...
回答于 2025-07-01 10:29
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老师，cellranger count 报错：job failed in stage code怎么解...
你的任务系统杀死了，共享服务器会自动杀死占有cpu多的任务
回答于 2025-06-26 17:40
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老师 就是在做群体structure分析的时候，clean.vcf.gz文件是下面...
你的染色体ID是不是搞错了，每个染色体只有一个SNP；你到基因fa文件里面看看，检查一下； grep '>' genome.fa#或者gzzcat genome.fa.gz|grep '>'
回答于 2025-06-23 14:50
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RNAseq有参转录组分析差异表达分析免疫亚型之间差异表达这一环节...
edgeR包版本更新了， 代码里面的decideTestsDGE 改成 decideTests
回答于 2025-06-20 16:11