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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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轨迹分析出现killed报错

电脑内存不够就会被KILL,查看内存使用情况: free -h 你看看这个设置docker内存使用:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2025-12-02 21:13

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本地镜像代码运行不了

linux 和windows 换行符兼容问题::用专业的文本编辑器并设置utf-8编码:https://www.omicsclass.com/article/395

回答于 2025-12-02 12:06

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可能是路径出了问题,无法找到脚本,请问老师

新版本的基因家族docker镜像文件才有iqtree2软件,老版本的没有 如果购买我们的课程可以找客服索要新版本镜像:联系客服处理:点击联系客服

回答于 2025-11-29 08:26

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在RStudio上用setwd()命令未能修改数据资料路径

你在我们云服务器上运行的Rstudio还是本地电脑安装的Rstudio 如果是云服务器上的Rstudio 里面的目录和本地电脑的目录没有关系,报错正常的; 如果是自己电脑安装Rstudio 你要检查你的D盘是否有这样的文件夹;建议截图说明问题

回答于 2025-11-27 09:17

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单细胞测序cellranger分析

云服务器putty登陆的时候有个 使用手册 你看看的 查看磁盘使用空间; cellranger 跑原始测序数据 数据量大,确保磁盘空间足够才行。删除一些没用的数据; Rstudio卡住参考:https://www.omicsclass.com/article/2080

回答于 2025-11-10 17:31

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成纤维细胞分好的亚组添加到总的组中

R代码如下: library(dplyr)metadata <- metadata %>%  left_join(fib_info, by = "cell_id") %>%  mutate(celltype_fib = ifelse(celltype == "fib", fib_subtype, celltype))

回答于 2025-11-09 16:02

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单细胞转录组课程findallmarker中的KEGG和GO富集分析,对于不是...

非模式物种没有现成的GO和KEGG注释数据库,可以自己构建注释数据库做分析, 可以看转录组课程里面有介绍:https://bdtcd.xetslk.com/s/29EigM

回答于 2025-11-07 17:30

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使用monocle2进行轨迹分析报错

这是由于igraph 版本高,导致 monocle2 与igraph版本冲突报错,这个问题需要 更改 monocle2的源代码 才能适应高版本的igraph。可以使用 5版本的镜像:single-cell-v5.0.tar.gz monocle2。 并且已经更新绘制热图; 代码已经更新:https://bdtcd.xetlk.com/s/4i88K6

回答于 2025-11-06 13:28

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新上的空间转录组课程可以用于分析华大基因测的数据吗

可以的需要转换一下才行;

回答于 2025-11-06 11:21

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docker镜像加速和教程界面不一样,不设置镜像加速下载速度很慢,...

dockerhub 国内上不了,有购买我们课程可以联系客服处理:点击联系客服

回答于 2025-10-15 12:15