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gff文件中，左侧第一列中，AC. AP. Mt Pt. Syng~是什么...
GFF的第一列为染色体ID（对于组装到染色体的物种），或者基因组DNA序列ID（没有组装到染色体），cds是基因ID，两种ID不一样。 Mt Pt应该是，物种的线粒体，和叶绿体序列，其他的不太清楚，你查看一下基因组说明；
回答于 2019-10-18 13:48
老师您好，我在作比较基因组学，麻烦您帮我看看这两个文件bed和c...
看你的ID应该都是一致的。 可能是因为用python版本的mcscan程序的bug，建议你把所有的.1删除试一下；
回答于 2019-10-18 13:43
Rstudio 打开后报错Required package ，更新安装包后仍然不行，...
建议卸载重新安装R和Rstudio。 生物信息入门到精通必修基础课：linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精通
回答于 2019-10-18 10:34
老师您好，我看到您的文章里有批量修改序列ID的操作，那Figtree...
修改进化树名字可以参考：https://www.omicsclass.com/article/675 ID少的话手动在nwk文件里面修改就行，用notepad++或者editplus打开nwk文件就可以；
回答于 2019-10-18 09:56
Figtree里批量改颜色请问一下需要怎么操作呢？不是所有的序列都...
建议使用evolview编辑美化进化树，里面有批量修改颜色：https://www.omicsclass.com/article/671
回答于 2019-10-17 20:52
Rstudio中每次开机后运行python代码，总提示这个错误，重新安装...
看到有编码错误，建议不要在代码中出现中文，处理中文很麻烦； 另外统一一下编辑器的编码格式为utf-8； Rstudio主要是用来编写和运行R语言代码的，python代码编写运行建议用pycharm。 生物信息少走弯路建议学习： 生物信息入门到精通必修基础课：linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数...
回答于 2019-10-17 13:31
circos中热图部分画不出来
你的配置文件写错了吧，建议你看看官方的说明：http://circos.ca/documentation/tutorials/ 看看 HIGHLIGHTS 部分
回答于 2019-10-17 10:27
circos作图时，热图那个圈出现问题，画不出来
参考一下别人是如何描述问题的：https://www.omicsclass.com/question/1280 这样我们才好帮你发现问题，解决问题；
回答于 2019-10-16 18:07
但是string数据库里没有丹参这个物种怎么办
里面应该有模式动植物的互作网络，建议用你丹参的基因同源比对一下拟南芥的基因，看对应的拟南芥基因是否有互作关系，再映射到自己的基因上；
回答于 2019-10-16 18:04
string只能预测已知蛋白的互作蛋白，不能看两组特定蛋白是否互作...
一个物种的所有蛋白互作关系都在数据库里面，你想得到特定的，搜索一下对应的ID号就好了；
回答于 2019-10-16 10:26