omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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老师好，有个文章中的基因家族成员列表中的Genomic locus的 BAC/...

你看到的name可能是别人重新命名了，你可以看看文章里面有没有附录，可能有对应的基因组上的ID，就行我们课上讲解的白菜WRKY那两个文章的：基因家族分析实操课程、

回答于 2019-10-31 14:29

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基因表达量的值一般符合负二项分布的。

回答于 2019-10-31 10:12

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p=0.05/n(n为标记数） p=0.01/n(n为标记数）都是可以的，这就是Bonferroni校正。做GWAS分析现在用重测序技术也就是利用SNP标记进行关联分析，重测序数据SNP的标记至少都是百万级的。所以通过矫正之后p值就很小了；

回答于 2019-10-31 10:11

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一个projet下面可以有很多biosample，是可以上传到一个bioproject下面的，一篇文章有可能既做了二代测序又做了三代测序；三代数据也是上传到SRA数据库，对上传不了解可观看视频课程学习：NCBI数据上传、二代fastq测序数据解读、

回答于 2019-10-31 09:55

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你文件里面是不是多了这个，你把它删除试试

回答于 2019-10-31 09:51

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网络图绘制可参考：OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程

回答于 2019-10-31 09:49

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网络图的绘制可观看，里面有详细操作演示说明：、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程

回答于 2019-10-31 09:48

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你输入的clustalw序列里面有重复的ID，你需要修改一下，再输入。类似问题: https://www.omicsclass.com/question/1621

回答于 2019-10-30 12:45

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ensembl上下载的应该没有问题的，你再仔细检查一下。再多看看其他的ID，GFF里面的ID与cds pep序列的ID手动搜索对应看看；

回答于 2019-10-30 09:32

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不知道你是那一步出现错误，过不去。 MCScanX安装问题我们有biolinux虚拟机，软件都安装好了，直接用就可以，mac上安装虚拟机：https://www.omicsclass.com/article/526 共线性分析有视频课程建议学习：学习链接：基因家族分析实操课程、

回答于 2019-10-29 14:20