4072 个回答
Python 版mcscanx出现AttributeError: 'LayoutLine' object has...
你文件里面是不是多了这个，你把它删除试试
回答于 2019-10-31 09:51
获得结构域后进行clustalw比对没有结果
你输入的clustalw序列里面有重复的ID，你需要修改一下，再输入。 类似问题: https://www.omicsclass.com/question/1621
回答于 2019-10-30 12:45
老师您好，这两天在ensembl上下大豆整个的注释文件之后，打开发...
ensembl上下载的应该没有问题的，你再仔细检查一下。 再多看看其他的ID，GFF里面的ID与cds pep序列的ID手动搜索对应看看；
回答于 2019-10-30 09:32
mac上如何安装和使用mcscan做共线性分析？
不知道你是那一步出现错误，过不去。 MCScanX安装问题我们有biolinux虚拟机，软件都安装好了， 直接用就可以，mac上安装虚拟机：https://www.omicsclass.com/article/526 共线性分析有视频课程建议学习：学习链接：基因家族分析实操课程、
回答于 2019-10-29 14:20
运行echo "dup_gene_paired.fa dup_gene_paired.aln dup_gene_pa...
这个是快捷方式，你可以按照视频中的操作手动运行clustalw，这样可以设置其他不同的选项； 学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读
回答于 2019-10-29 10:36
宏病毒组得到的contig如何做系统发育分析，包括如何选取合适的序...
可以预测里面的基因，然后把基因截取出来，不同的样品按照基因的顺序链接成一个supergene，然后做多序列比对（clustalw），之后做进化树（MEGA）。 序列的批量截取合并，建议学习perl，或者python 生物信息入门到精通必修基础课：linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据、perl入门到精...
回答于 2019-10-29 09:54
如何用荧光定量数据绘制热图？
为了是热图每一行对比明细，使热图很好看，热图一般按行均一化数据。所以，legend会有负数。聚类热图绘制见：https://www.omicsclass.com/article/528 qpcr的计算方法见:https://www.omicsclass.com/article/446
回答于 2019-10-29 09:47