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空间转录组分析非模式物种参考基因组构建

你的GFF文件格式不标准,自己整理一下,或者去别的地方比如ensembl网站下载,这个网站整理的基因组比较规范; 参考基因组建立: https://en.stomics.tech/service/new-saw-operation-manual.html

回答于 2026-01-05 16:02

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我更改文件名之后还是会复制不成功,这条命令应该怎样更改才正确...

R Studio 显示的路径是容器外的路径, 你现在是在容器内,需要用容器内的文件路径,你 cd ls 两个命令在容器里面熟悉一下文件路径;

回答于 2026-01-04 16:38

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你好老师为什么这里无法启动镜像

这个参数去掉试试:

回答于 2025-12-29 11:58

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空间转录组saw count 运行到register时报错

有没有运行成功的样本? 如果没有,可能是电脑内存不够导致: free -h 查看一下内存多不多最好贴一下运行的命令行,是不是命令行写错了,导致; A04244C4_ssDNA.tar.gz 检查图片压缩包里面是不是缺了文件, 参考这里使用原始图片输入试试:--image https://stereotoolss-organization.gitbook.io/saw-user-manual-v8...

回答于 2025-12-22 11:37

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无法登录PuTTY

密码是不是输错了,重新输入一下; putty输入密码的时候没有任何提示,正常的,不要反复粘贴密码;

回答于 2025-12-10 15:38

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重测序var_density.R脚本报错

基因组没有组装到染色体水平,序列碎的太多报错正常的;

回答于 2025-12-06 17:27

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提供感兴趣基因进行分支分析时,出现Error in simple_vs_index(x...

看看这个图你的有没有 圆圈 2 :

回答于 2025-12-04 14:27

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轨迹分析出现killed报错

电脑内存不够就会被KILL,查看内存使用情况: free -h 你看看这个设置docker内存使用:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2025-12-02 21:13

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本地镜像代码运行不了

linux 和windows 换行符兼容问题::用专业的文本编辑器并设置utf-8编码:https://www.omicsclass.com/article/395

回答于 2025-12-02 12:06

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可能是路径出了问题,无法找到脚本,请问老师

新版本的基因家族docker镜像文件才有iqtree2软件,老版本的没有 如果购买我们的课程可以找客服索要新版本镜像:联系客服处理:点击联系客服

回答于 2025-11-29 08:26