omicsgene
omicsgene - 生物信息
实名认证 专业认证

性别: 北京 - 北京市 注册于 2018-04-20

擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

生物信息

向TA求助
14227金币数
80420 经验值
442个粉丝
主页被访问 84534 次

4072 个回答

0 赞同

老师,请问我在甘蓝型油菜A09 染色体定位出一个区段200kb ,如何...

可以用MCScanX做比较基因组分析,看看其他地方是否有同源区域,具体操作过程可看基因家族实操课程:学习链接:基因家族分析实操课程、

回答于 2019-11-11 13:55

0 赞同

请问老师,gff 文件中有id 信息,但是cds 文件中只有转录本信息...

查看自己的GFF格式是否标准,主要看第二列,和最后一列;  第二列得有gene,mRNA信息,最后一列的ID要与CDS里面的转录本ID一致。就能适用课程中的脚本: https://www.omicsclass.com/article/816

回答于 2019-11-11 13:53

0 赞同

paml运行时出现问题,该怎么解决?

我看没有出错,叫你继续

回答于 2019-11-11 10:25

0 赞同

转录组问题

这个问题有很多原因,实验处理设计,取样原因等等都会影响上下调关系,我这边不好给出确切原因。

回答于 2019-11-11 10:24

0 赞同

如果用blastp来找到的基因家住成员D或从已发表的文献中已获知家...

只要是ID列表就行,都可以使用的,程序主要读取文件第一列ID数据 除非是要截取结构域所在的位置,domain序列需要后续的位置信息。

回答于 2019-11-11 10:22

0 赞同

老师您好,请问一下在做WGCNA的时候,形状数据文件具体是哪种的...

是性状或者表型数据吧, 这个是样品的一些调查数据,如果你的样品没有表型数据就不能做关联数据

回答于 2019-11-11 10:21

0 赞同

老师,您好。我完全按照视频课程整理好自己的数据,按照相同的操...

看你用记事本编辑文件,可能遇到linux和windows编码不同导致错误(换行符不同),建议用专业的文本编辑器软件 notepad++; 并设置一下统一编码UTF-8格式:https://www.omicsclass.com/article/395 然后再根据课程中的示例数据,整理自己的数据再分析。

回答于 2019-11-11 10:20

0 赞同

qPCR问题

这个不太清楚,计算结果你可以看看:https://www.omicsclass.com/article/446

回答于 2019-11-11 10:15

0 赞同

mapman Mercator注释碱基序列过长如何解决?

建议删除那条序列

回答于 2019-11-11 10:14

0 赞同

你好,冒昧打扰!我是小白,想向你请教mapman问题。就是自己数据...

需要自行进行注释匹配:https://www.omicsclass.com/course/26

回答于 2019-11-11 10:14