ggplot2主题theme参数

ggplot2绘图theme参数设置 theme(line, rect, text, title, aspect.ratio, axis.title, axis.title.x,  axis.title.x.top, axis.title.y, axis.title.y.right, axis.text, axis.text.x,  axis....

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-08-08 17:50
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rmvnorm函数生成随机矩阵

借助rmvnorm()生成一个多维正态随机矩阵 安装mvtnorm包 > install.packages("mvtnorm")> library(mvtnorm) 生成随机矩阵x=rmvnorm(n,mean=rep(0,nrow(sigma)),sigma=diag(length(mean)…)...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-25 11:42
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eclipse当中R插件StatET安装

StatET是一个eclipse R语言高亮显示插件,可以高亮显示R语言代码。安装之前请在电脑中提前安装好R编译环境。 支持在Eclipse平台上(通过将代码发送到R)运行R代码 支持语法高亮显示 支持使用R代码模板 支持创建R的文档文件(*.Rd) 可以从Eclipse运行R命令

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-18 16:19
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删除向量中指定的元素(借助向量中元素索引)

在进行数据处理的过程中,可能会要求删除向量中某个指定的元素,这一操作可以利用R 语言向量中每个元素都对应一个索引完成,而获取索引下标可以利用which(),而match()只会返向量中第一次出现的...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-16 18:05
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创建有序因子

利用factor() 或者ordered() 两个函数将普通变量转换成有序因子。

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-13 17:29
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GEOquery 读取本地表达矩阵压缩包

利用GEOquery包的getGEO()可以进行芯片相关数据的下载,不过,有人反映不少芯片的表达矩阵下载经常出错,可以通过手动下载的方式将矩阵文件下载到对应的工作路径中: 矩阵文件的基本命名格式...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-06 16:00
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R语言绘制维恩图空值NA处理

行数不同的数据读入R,批量去除NA,绘制韦恩图。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-05 16:16
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Vennerable绘制维恩图颜色比较丑如何自己设置颜色

Vennerable绘制维恩图颜色比较丑如何自己设置颜色。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-04 12:02
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R语言统计相同ID出现的频率并用ggplot2绘制柱状图

统计相同ID出现的频率,并用ggplot绘制柱状图;

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-01 15:46
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R语言统计数据范围并用ggplot2绘制柱状图

R语言,按数值范围统计频次,绘制柱状图

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-01 15:33
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R处理大数据时内存out of memory的问题

R处理大数据时偶尔会出现out of memory的问题,相关解决方法: 1、memory.size()查看当前work space内存使用状况(MB) 2、memory.limit()查看当前work space运行使用内存的上限 > memo...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-29 13:16
  • 阅读 ( 4268 )

R 删除重复数据

R 删除重复数据的方法,包括duplicated 和unique 针对duplicated, 对向量的元素或数据框的行进行操作的时候,返回逻辑值,以下面的数据框为例:  dat   A B C D1  a b a c2  c k b d3  c k c c4...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-27 22:00
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Hierarchical clustering主要聚类方法与R语言中聚类函数的应用

系统聚类Hierarchical clustering(层次聚类、谱系聚类)— 最短距离法(single linkage)— 最长距离法 (complete linkage)— 中间距离法 (median method)— 可变距离法 (flexible median)— 重心...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-22 12:11
  • 阅读 ( 6859 )

ggplot2几何设置——geom

列举ggplot2的geom设置内容,方便查找绘图对应方法

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-22 09:59
  • 阅读 ( 5435 )

火山图--ggplot2

利用ggplot2进行火山图的绘制

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-15 09:59
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melt函数对数据进行整合

借助reshape2包melt函数对数据进行整形处理,改变数据组合方式

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-15 09:30
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绘制类似于箱线图的散点图

使用R语言绘制类似于箱线图的散点图

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-08 12:06
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linux系统当中源码安装R,无root权限安装

1.安装zlib1.2.5版本及以上 cd zlib-1.2.11 ./configure --prefix =/share/work/biosoft/zlib make make install 2.安装bzip cd bzip2-1.0.6 make -f Makefile-libbz...

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-02 18:03
  • 阅读 ( 6044 )

R-对NA 数据进行处理

对数据中存在的NA情况进行处理,替换或者删除

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-01 13:54
  • 阅读 ( 2739 )

R数据集合并

在进行数据集处理时,经常会合并两个数据集,这里说一下合并数据集常用的2个函数: 合并列:cbind 合并行:rbind 1.cbind cbind使用非常直观简单。当我们需要直接合并2个矩阵或数据框,不需...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-01 13:03
  • 阅读 ( 3350 )