你好老师,在基因家族比较时候,准备bed文件和CDS文件问题

在基因家族比较时候,准备bed文件和CDS文件问题时,由于水稻的基因ID和转录本ID不一样,所以看了课程的最后一节课,此时有了OS.bed,然后去使用getgeneid_mrnaid的脚本,想得到基因ID和MRNA ID文件,可是在使用时出现这个报错。attachments-2019-11-UvMeHdKc5dcff8711d5a1.png

然后去GFF 文件里搜索


attachments-2019-11-xO0cUSa95dcff9d4d0789.png可能是这没gene原因,这个也没什么用,该怎么避免这个报错,或者跳过呢

谢谢老师啦!

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

用notepad++打开这个文件,删除这个信息,重新运行脚本;

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  • 有我在 提出于 2019-11-16 21:32

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