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Tbtool中Quick Mscanx Wrapper使用的时候总是得不到结果

没用过tbtools 做共线性分析建议使用MCScanX之间分析:https://www.omicsclass.com/article/275 或者观看基因家族分析课程,里面有详细的使用教程: 《基因家族分析实操课程》

回答于 2019-10-23 12:01

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gzip: Phaseolus_vulgaris.PhaVulg1_0.45.gff3: Protocol error

看看文件是否下载完整,重新下载文件吧;

回答于 2019-10-23 11:59

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Failed to open tabular per-dom output file zf-C2H2.txt for w...

当前目录没有写的权限,挂载共享目录的时候不要勾选只读分配; https://www.omicsclass.com/article/260

回答于 2019-10-22 14:43

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想问问进化树外面的各个亚族的环是怎么做的,第二就是树枝末端的...

可以使用evolview在线工具完成:https://www.omicsclass.com/article/671

回答于 2019-10-22 09:50

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请问用TBtools在进行 进化树+基因结构+motif—1张图全显示的时候...

进化树里面的ID和gff里面的ID一致就好了,我看你的ID不一样,你修改一下就好了; GFF格式你要了解一下,ID是哪个课程里面有详细讲解::基因家族分析实操课程

回答于 2019-10-22 09:47

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老师你好,blast分析串联重复基因结果文件duplication_gene.out...

不同的筛选方法(blast手动筛选法,MCScanX软件筛选方法),筛选的条件有区别,可能得到不同的结果,以一种方法为准即可。

回答于 2019-10-21 15:46

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在利用脚本得到重复基因的时候出现了报错open failed

检查所有输入文件路径或者文件名是否写错。linux基础不好建议学习:linux系统使用

回答于 2019-10-21 14:45

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请问预测信号肽或者蛋白质亚细胞定位的网站有吗?

可以参考一下这个:https://www.omicsclass.com/article/1438 

回答于 2019-10-21 10:46

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请问预测信号肽或者蛋白质亚细胞定位是用什么方法做的呢?谢谢老...

可以试试下面这些工具,预测信号肽,还有亚细胞定位的:  https://www.omicsclass.com/article/1438  AMINO ACID SEQUENCESProtein sortingChloroP » ChloroP | Download softwareChloroplast transit peptides and their cleavage sites in plant proteinsDeepLoc »Prediction of eukaryotic protein subcellular localiz...

回答于 2019-10-21 10:28

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python统计fasta格式的序列文件信息,包括长度,碱基数量等

python 处理fasta序列,建议用biopython包处理,会方便很多;

回答于 2019-10-20 20:30