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构建进化树时,有一个基因家族成员的domain序列太短,成列删除ga...

你检查一下那个domain 是不是真的短,可以延长一下截取区间看看序列是不是完整的结构域; 或者 确认有问题直接删除这个基因;

回答于 2019-12-05 09:43

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cg view使用问题

你需要做COG注释,然后整理相应的表格数据才可以添加到图上面:https://www.omicsclass.com/article/552

回答于 2019-12-05 09:41

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老师,您好,我是在做有参转录组分析。在对基因组构建HISAT inde...

怀疑GTF格式有问题: 检查你的GTF与课程里面的GTF格式上有啥区别,对应修改一下;

回答于 2019-12-03 16:08

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关于WGCNA模块hub基因筛选的问题

可以观看我们的视频课程,里面有详细介绍:WGCNA-加权基因共表达网络分析

回答于 2019-12-03 10:21

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请问转录组差异分析里的log2FC是怎么算出来的?

高通量转录组里面做差异分析,用edgeR  或者DEseq2等R包分析后,自动就有了fold change 值,不需要自己去计算。

回答于 2019-12-03 10:18

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circos图画共线性图时,因为家族的基因很多有50+,如何让所有的基...

可以采用新的配置文件,将基因显示在外圈,见:https://www.omicsclass.com/article/644

回答于 2019-12-03 10:04

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基因家族分析时获取基因与mRNA的对应关系

你的mRNA有些没有Parent 信息,所以脚本不知道你的mRNA来自于哪个gene,因此报错,你把你GFF文件都看看整理好;

回答于 2019-12-03 10:01

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下载COAD数据提示列不一致保存不成功

可能有些文件下载不完整,建议换个目录重新下载运行代码。

回答于 2019-12-03 09:58

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老师,请问热图数据可以行列同时标准化吗,还是只能行/列一者标...

只能选其中一个,不能同时

回答于 2019-12-02 21:37

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共线性分析 视频介绍的不详细

wget下载下来的是示例数据,你要理解文件里面放的是什么数据,视频中都有介绍; 然后把文件中的数据替换成自己的数据,最后出来的结果就是自己的; /biosoft/MCScanX/MCScanX/MCScanX  这是我们安装好的mcscanX软件的路径,最右边的/  不要丢了。 请安装我们提供的biolinux,才有这个软件:https://www.omicsclass.com...

回答于 2019-12-02 21:35