你检查一下那个domain 是不是真的短,可以延长一下截取区间看看序列是不是完整的结构域; 或者 确认有问题直接删除这个基因;
回答于 2019-12-05 09:43
你需要做COG注释,然后整理相应的表格数据才可以添加到图上面:https://www.omicsclass.com/article/552
回答于 2019-12-05 09:41
怀疑GTF格式有问题: 检查你的GTF与课程里面的GTF格式上有啥区别,对应修改一下;
回答于 2019-12-03 16:08
高通量转录组里面做差异分析,用edgeR 或者DEseq2等R包分析后,自动就有了fold change 值,不需要自己去计算。
回答于 2019-12-03 10:18
可以采用新的配置文件,将基因显示在外圈,见:https://www.omicsclass.com/article/644
回答于 2019-12-03 10:04
你的mRNA有些没有Parent 信息,所以脚本不知道你的mRNA来自于哪个gene,因此报错,你把你GFF文件都看看整理好;
回答于 2019-12-03 10:01
wget下载下来的是示例数据,你要理解文件里面放的是什么数据,视频中都有介绍; 然后把文件中的数据替换成自己的数据,最后出来的结果就是自己的; /biosoft/MCScanX/MCScanX/MCScanX 这是我们安装好的mcscanX软件的路径,最右边的/ 不要丢了。 请安装我们提供的biolinux,才有这个软件:https://www.omicsclass.com...
回答于 2019-12-02 21:35