gff文件里的geneID和CDS,蛋白质里的对不上,下载了好多版本都这样,有什么办法处理一下吗?

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omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

GFF里面把gene;  还有transcript:  等删除,然后用mRNA的ID到cds或者蛋白质序列文件里面搜索一下看看能不能搜索到。多搜搜几个基因试试; 

如果没有一个对应上的,你再查看基因组文件的说明,看看是不是下载错了文件; 

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  • Triste 提出于 2019-11-29 10:17