omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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我在构建进化树的时候，分类依据是拟南芥的分类和进化树本身的特...

分组这个需要调整，你再琢磨琢磨。看看基因序列特点。

回答于 2019-11-28 22:33

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可能你那里点错了吧，应该是有的；

回答于 2019-11-28 22:32

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你的转录本ID与基因ID一样，不影响的；

回答于 2019-11-28 22:31

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你查看一下具体的结构域是否完整，详细了解自己的基因家族结构域特点，可适当调整位置再截取；

回答于 2019-11-27 13:17

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你说的硬盘，和内存没有关系； hisat建立索引需要很多内存，报错信息也说明内存不够；建立人类基因组索引3G，大概需要150G的内存，你看看你的应该增加物理内存；虚拟机做转录组分析比较困难。

回答于 2019-11-27 13:15

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文件没有找到，命令行没有写完整吧，缺少文件，你检查一下；

回答于 2019-11-27 13:14

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是文件不存在的意思，你再看看英文意思：标红的文件路径不对：

回答于 2019-11-26 17:33

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建议使用evolview美化进化树：https://www.omicsclass.com/article/671

回答于 2019-11-26 10:38

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蛋白质和cds序列都可以；但是由于用mcscanX和blast方法去筛选可能导致结果不一致，结果任选其一就行；

回答于 2019-11-26 09:58

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检查输入文件的ID是否对应；

回答于 2019-11-25 15:47