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有没有GWAS做之前的表型数据一致性分析教程
分析正态分布、方差齐性和差异显著性？Graphpad和SPSS都可以做技巧（4）——GraphPad进行单因素方差分析与多重比较 - 知乎
回答于 4天前
老师我排查问题发现ALLHiC_partition这一步只能生成一个txt文件
“更改了酶切位点改为2以后能生成11个文件，得到的热图....”这个最下面的热图不是蛮正常的吗？标度尺也是正常的。然后你的groups.hic.heatmap的文件夹里面还有一个500K_all_chrs.pdf，那个图里面有几个小图？是11个吗？我不知道你的k设置的是多少？是11吗？
回答于 2026-03-19 16:36
geneflow
你的树每个节点的高度都完全不同且单调递增，DFOIL_Picker_mod_noEdge.R 对于每个节点又只考虑高度大于或等于当前节点高度的其他节点（脚本133行）。这就导致在进行组合的时候，每个节点要么没有足够高的其他节点，要么符合条件的节点都是自己的后代而被排除。所以没结果是树形导致的。要么把70行注释掉不用。或者62行注释...
回答于 2026-03-18 10:42
conda
直接which conda之后找到conda所在文件夹，删除这个文件夹就行了。记得删除配置文件 .bash_profile中关于conda的内容或者你参考这个
回答于 2026-03-16 11:14
GWAS获得显著位点如何去设计分子标记？
一般会通过第一种方法“通过结合表型值判断不同基因型是否存在显著差异”。“优势单倍型”是指引起表型变化的还是指占比最高的单倍型，如果是占比最高的，那设计标记进行分型得目的和表型怎么关联呢？
回答于 2026-03-16 11:11
老师我的第八步生成共线性的我发现使用这个代码共线性图也是空白...
你发的文件里面全是截图，我这边是完全看不清楚内容的，提问建议提供运行命令、输入文件截图和报错信息。你第一次做的那个是划分成了chr的状态（蓝色框），第二个做的里面只有contig（绿框）而没有挂载到染色体上的信息，正常应该是这样：在你没有chr（或者说是一条很大的染色体）的时候去绘图会报错，比如说你指定了需要画...
回答于 2026-03-12 14:14
老师我更改了酶切现在是这样但是热图的pdf又是正常的
你的酶切和公司给你的现在是一致的吗？demo里面热图的图例你可以参考一下：如果你酶切和真实的保持一致了，那就尝试juice box右侧那个颜色标尺，你往左边滑一下。
回答于 2026-03-11 17:41