Ti Amo 的回答 - 组学大讲堂问答社区

0 赞同

我的all.chr.hmp.txt.gz文件大小是4.6G再跑gapit的模型总报错

看不到kill的原因，推测是内存或者存储问题

回答于 1天前

0 赞同

这个r脚本可以做改动（推荐优先更改宽高等信息），但是也不是全部适配的，直接ps或者ai修改吧。

回答于 2天前

0 赞同

需要hapmap.txt.gz文件内容的截图，报错是格式问题

回答于 5天前

0 赞同

有报错信息吗？hicxbly_aligned.REduced.paired_only.bam没问题的话可能xblysample.clean.sam的头文件不完整，并且要求BAM 和 SAM 的染色体/contig 名称必须完全一致，可以从这两个角度检查一下

回答于 2026-05-15 17:59

0 赞同

极端假阳性了。可能群体分层严重、存在亲缘关系没有较正、表型数据被当作协变量输入等原因都有可能。换一个模型也是这样的结果吗？

回答于 2026-05-15 15:45

0 赞同

红色失败表示在你软连接的绝对路径下面没有这个文件，需要你提供/work/my_pan-gene-family/data/下面得截图。在容器下面操作： l /work/my_pan-gene-family/data/

回答于 2026-04-29 16:53

0 赞同

maf降低、maxmissing降低、minGQ降低，以及等位基因数目不限制那么死就可以增加可用位点。

回答于 2026-04-28 10:30

0 赞同

这个是plink 1.9会出现的，自己升级到2.0就没事了。其实并没有真实的错误，可以看结果文件，也是全的。直接往下进行就可以了。

回答于 2026-04-22 10:05

0 赞同

分析正态分布、方差齐性和差异显著性？Graphpad和SPSS都可以做技巧（4）——GraphPad进行单因素方差分析与多重比较 - 知乎

回答于 2026-04-10 10:21

0 赞同

“更改了酶切位点改为2以后能生成11个文件，得到的热图....”这个最下面的热图不是蛮正常的吗？标度尺也是正常的。然后你的groups.hic.heatmap的文件夹里面还有一个500K_all_chrs.pdf，那个图里面有几个小图？是11个吗？我不知道你的k设置的是多少？是11吗？

回答于 2026-03-19 16:36