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微生物共现网络问题

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为什么这两次是一个文件，只是改变了核数，输出的结果却不一样了

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老师，我想把镜像复制到自己服务器上使用，使用的是singularity run reseq.sif，为何进入容器以后软件都用不了呢，是哪里出了问题？

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10 空间转录组分析非模式物种参考基因组构建

3 解决

我更改文件名之后还是会复制不成功，这条命令应该怎样更改才正确，位置路径在R中显示是home/gene/genome

  • xxx 2026-01-04 15:37
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泛基因组

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想知道怎么将自己要做的基因复制到工作目录，就这个chengrong gene文件

  • xxx 2026-01-04 14:40
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在用GEMMA软件进行GWAS分析的时候，需要加入Q矩阵，有一个疑问

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泛基因家族分析，核心基因等数量统计

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10 您好，请问SNPT软件失效了

  • cc 2025-12-31 16:09
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基于图形泛基因组文件call取sv的时候，运行命令nohup vg call new_index.giraffe.gbz -r new_index.snarls -k D23.pack -a -A -t 30 -s D23 > D23.vcf 2>call.o &，显示done，但生成的vcf文件里面没有变异位点，只有个头，如截图中所示。这种问题怎么解决呢？

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EMMAX进行GWAS分析时候出现问题

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泛基因家族做完PAV分析后，发现有的物种没有任何一个基因

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你好老师为什么这里无法启动镜像

  • Nier 2025-12-27 18:23
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在基因组注释部分有一条命令RepeatMaskerLib=/share/work/biosoft/RepeatMasker/RepeatMasker/Libraries/RepeatMaskerLib.h5用来指定RepeatMaskerLib所在位置，那这里如果是要在自己的电脑上跑的话这里路径变量应该在哪呢

  • Nier 2025-12-25 12:20
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泛基因组基因家族_PAV分析，核心和可变基因富集分析问题

  • Oho 2025-12-25 09:56
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空间转录组saw count 运行到register时报错

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5 你好，我和你遇到了同样的问题，请问你现在这个问题解决了吗？

  • 2025-12-18 16:04
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5 你好，请问你当时提出的那个问题解决了吗，我现在也是卡在这一步了，求指教

  • 2025-12-18 16:02
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单倍型分析