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根据没有标识转录本是1还是2或3的IDlist基因号名单,在标识了转录本的蛋白质序列文件中搜索,可以把IDlist名单中的所有转录本蛋白序列搜索出来吗?可以改命令达成?这是我的命令seqkit grep -f Nramp_IDlist_final.txt arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.CCJH.protein.faa -o Nramp_pep_final.fa 我把IDlist里面名单后面都加了转录本号才搜出来。?
如意
2025-04-17 13:47
1
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GATK 很慢,怎样分染色体CALL 变异
GATK
HaplotypeCaller
郭老师
2025-04-17 10:43
1
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我在做T2T,docker下载T2T镜像错误
t2t
青春无悔
2025-04-17 09:51
1
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老师,我正在做泛基因家族分析的结构变异与基因注释部分,出现一些错误
Connie
2025-04-16 23:15
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基因家族分析之基因结构分析
荣
2025-04-16 23:03
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GFF文件格式不标准
注释文件
ZZZZZZZZZ
2025-04-16 21:51
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泛基因家族鉴定-找不到Bio::SeqIO模块
Bio::SeqIO
Q_C
2025-04-16 13:28
1
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170
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宏基因组数据预处理问题
mmvec
murakami
2025-04-16 10:40
1
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windows10安装docker后,输入命令,报错,请问如何解决?
Docker Desktop
向阳而生
2025-04-16 09:06
1
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160
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代谢组数据正态检验
正态分布检验
murakami
2025-04-15 16:22
2
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156
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老师上课的内容,为什么我的demo里面没有东西?
xiang午燕
2025-04-15 15:49
0
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基因家族生信
有点小倔犟
2025-04-15 09:51
2
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文献给的下载基因组网站下载不了花生基因组数据,ensemble下载的信息又不全,咋整啊,老师?
如意
2025-04-14 22:32
0
回答
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浏览
我鉴定的家族成员的基因ID和已经发表文献的基因ID不一样,如何让两者对应起来?下图左侧是文献中的基因ID,右侧是我鉴定出来的基因ID,数量一致。
如意
2025-04-14 18:06
1
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lefse分析细节
差异分析
murakami
2025-04-14 17:59
1
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浏览
老师,我正在做泛基因家族分析的系统发育树构建,构树过程中,出现以下的过程及警告,请老师帮忙看看是否正常,这些重新序列的编号是否有影响(序列对其修剪后有重复名称已去除),以及我下面的系统发育树这么多是否正常,还是需要筛掉一些?
泛基因家族分析
Connie
2025-04-14 12:42
1
解决
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老师您好,我在提取cds的时候报错了。他说第84行出错,然后我打开看了,感觉看不出什么问题呢老师
蚩尤
2025-04-13 20:07
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A基因家族的家族成员一共25个,但是23个成员是一个domain,只有是两个domain,这种情况,比较这个基因家族里面不同成员的蛋白全长是不是不合适?不容易得到25个成员的全蛋白进化树?
如意
2025-04-12 15:01
1
回答
163
浏览
请问老师,为什么显示找不到文件呢,已经尝试过重新传输文件
群体研究合辑(基因组重测序、遗传进化、GWAS、BSA)
docker
FileZilla
Faith_
2025-04-12 13:20
1
回答
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老师我做存在缺失分析部分,Fam_gene.list中泛基因编号为什么不是连续的呢
泛基因家族分析
Connie
2025-04-11 23:43
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