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使用eggnog对组装后的基因进行CAZy和EC酶的注释，一个序列会注释到多个正常吗？另外我还想问一下进行lda分析时，未注释到的功能或者基因应该删除吗

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组装后的cds.count文件里有小数是合理的吗

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请问，在基因组中提取包括UTR，CDS的基因序列，命令咋写？使得提取的UTR,CDS能自动拼接成一条序列。而且能一个命令出来的结果，能包含所有家族基因的UTR和CDS序列。

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老师，想问一下您，用blastp方法做基因家族成员鉴定时，鉴定到了51个成员，其中有几个成员的蛋白序列相似性大于98%，但是位于不同染色体上，这种是否需要删除多余的，只保留一条就够了？

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老师您好，在GWAS后分析添加基因与环境的交互项，使用什么方法比较好啊？

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linux 下 R 命令怎么后台运行

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omicsclass/pan-gene-family 为啥这个我在docker hub上没有找到呀

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老师好，我在做gwas分析小麦时，按照脚本进行vcftools 过滤生成clean.vcf.gz 文件后出现以下问题，该如何解决

  • Max 2025-07-17 10:14
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hic挂载时，选用那个内切酶

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你好，我在做小麦GWAS分析时，按照脚本过滤生成clean.vcf.gz文件，文件变得非常小怎么回事，修改过滤参数还是一样，到进化树分析时显示文件为空，有人能解答吗

  • Max 2025-07-15 11:10
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老师，在做蛋白预测的时候总是显示desired structure doesnot exist.

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sam文件转换成bam文件是不能识别头部信息

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进行GTDB注释时报错，报错信息为缺少参考基因组

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想获得某个染色体序列，命令是啥？

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GWAS分析的表型数据不符合正态分布，但是极值材料表型是真实存在的，所以是保留原始数据还是用IRNT转换表型值或者剔除不符合正态分布的值呢

  • 2025-07-11 23:22
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3 win11下，docker无法start

  • 2025-07-11 22:26
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STRING数据库映射出来的拟南芥基因号不是AT开头的

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我用gemma做小麦的gwas分析，到最后一步生成曼哈顿图时出错，是因为参考基因组的染色体编号与基因型数据对应不上吗，应该怎么老师解答

  • 2025-07-10 03:28
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老师，我做gwas分析过程中出现这种问题，该如何解决呢？

  • Max 2025-07-09 17:50
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老师，我做gwas分析过程中出现这种问题，该如何解决呢？