1 解决

GATK硬标记过滤速度慢

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老师们好，在生成gvcf文件合并vcf文件时，出现这种警告信息，请问是什么原因，如何处理啊？

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20 群体遗传构建进化树格式转换报错

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老师您好，使用beagle 进行基因型填充的时候填充依据是什么啊，是后台有参考数据库吗？

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SRA数据下载

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10 群体遗传分析中iqtree构建系统进化树出现警告和错误

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GATK 很慢，怎样分染色体CALL 变异

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重测序遗传变异过滤

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根据覆盖度及比对率如何剔除样品、gatk VariantFiltration过滤

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cnvpytor 不运行

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genome

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怎么从全部的300份重测序数据的vcf.gz文件中抽出自己的想要的200份数据

  • Max 2024-12-19 17:16
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单倍型分析

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SRA下载

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老师，麻烦您解答一下

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重测序

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重测序文件中的data data 文件打不开

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10 GATK报错Caused by: java.io.IOException: Input/Output error

  • YYJ 2024-12-30 20:45
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老师，在第三步vcf文件过滤时，得到的all.clean.vcf文件太小了，宽松设置调整数值后，依旧很小，怎么办啊，有没有其他的方法，可以让最后的数据大一些啊

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重测序