红橙子
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我做基因家族鉴定时为什么有些基因定位不到染色体上

组装基因组技术手段有限,会有很多序列组装不到染色体上,以大片段存在,所有有些基因不在染色体上是正常的。

回答于 2023-12-12 10:19

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structure_plot.r 停止调用

选项和参数之间没加空格  -d  ./  -s 那里

回答于 2023-10-13 10:07

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转录组自主分析的差异基因分析和KEGG富集分析时发生错误,求老师...

可能是kegg数据库更新所致,已提交更新计划

回答于 2023-10-08 19:35

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重测序mapping rates

怀疑数据有污染一般会随机选一些序列比对Nr库,看下序列比对到哪些物种及比例来判断。

回答于 2023-10-07 15:09

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PSMC如何在一同一张图里用不同颜色展示不同分组的样品

可以绘图后用ai软件编辑颜色

回答于 2023-08-28 17:11

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怎么提取蛋白质编码区和非编码区的序列

你的问题中存在歧义,一般说编码区指的是DNA或者RNA水平上的比如cds序列,既然都翻译成蛋白了就说明都是来自编码区。另外学会生信根据基因组序列文件和注释文件去提取各类型的序列非常简单,所以建议你去学习一下,只是提问我也没法给你演示,建议学一下这个课程:https://apphc8vuqty1843.h5.xiaoeknow.com/v1/goods/goods...

回答于 2023-08-25 16:20

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蛋白比对结果构建进化树_合并成supergene报错

根据报错信息,应该是由于文件"aln_out/991.pep_aln.renamed"无法被读取或找不到而导致的错误。请确认文件"aln_out/991.pep_aln.renamed"存在并且位于正确的路径下。

回答于 2023-08-14 17:53

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motif筛选的条件

Motif的长度通常是根据已知的基因或蛋白质序列中出现的频率最高的核苷酸或氨基酸序列来确定的,存在比比pfam数据库中更长的可能,如果一个Motif是特定蛋白质家族的一部分,那么它的长度可能会与Pfam数据库中的模式相似或更短。然而,如果一个Motif是更加广泛和通用的情况下,那么它的长度可能会更长。最终的决策需要基于实...

回答于 2023-08-11 19:31

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cafe做基因家族扩张和收缩,报错Failed to initialize any reaso...

报错信息提示可能需要尝试移除一些具有最大数量差异的家庭,并重新运行分析。出现初始化任何合理值失败的问题可能是因为输入的数据集存在问题,例如数据格式不正确、数据缺失或重复等。建议检查输入数据集的质量,并尝试解决任何可能的问题。

回答于 2023-08-11 19:29

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docker怎么设置镜像以及内存,最后一张图是基因家族分析课程里面...

有问题先在问答社区搜索下问题,设置内存问题已经有很多答案,检索下对应看下。

回答于 2023-08-10 19:05