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iTRAQ/TMT和Label-free技术都有哪些优缺点？
（1）定量准确性：iTRAQ/TMT的定量准确性和重现性要明显优于Label-free，Label-free的样本之间不能直接混合，导致定量的结果受到的影响因素多，因此定量结果的准确度较低；（2）鉴定通量：Label-free通量相对较高，而iTRAQ/TMT由于标记基团的影响，鉴定通量较label-free 低；（3）修饰组学：label-free定量，修饰肽段的富集...
回答于 2019-08-09 15:56
我想问一下怎么利用别人发表的转录组文章里面的数据分析自己基因...
别人发论文提交的数据一般是原始数据，想要得到这个实验里某些基因的表达量信息只能重新分析，也就是把转录组流程再跑一遍，这样就得到基因表达量信息了，但是这仅是这些基因在人家实验条件下的表达情况，假如他的和你的材料，处理条件等都一样，你也可以当做自己的数据来用的，希望能帮到你！假如需要分析数据可以联系我们...
回答于 2019-07-23 20:32
二代转录组测序reads与基因组比对后，没有相应的注释结果，我们...
新基因预测分析是将测序Reads比对至参考基因组，然后进行拼接，其中一些reads比对到基因间区并且能拼接出完整的开放阅读框，拼接出来的位于基因间区的这些基因即为新基因。预测得到的新基因再进行功能注释，因此注释结果与新基因的鉴定没有关系。
回答于 2019-07-18 09:46
组内某个生物学重复样品与其它相关性不太好怎么办？对文章发表有...
样品间的相关性反应了样品间的相似情况，样品间的相似度越高，样品间的差异基因越少。生物学组内重复样品的相关系数应大于组间样品的相关系数。 转录组测序通常要求设置至少3个生物学重复样本，如果出现某个样品与组内其它样本相关性不好的情况，可将该样本剔除，再进行差异分析。后期再通过生物学验证手段进行生物学验证...
回答于 2019-07-18 09:43
转录组测序可以解决的问题有哪些？
1. 可以从转录组水平整体评估外界条件引起的基因表达响应。 2. 对于检测低丰度转录本和发现新转录本具有独特优势。 3. 可以发现基因融合、可变剪切及结构变异
回答于 2019-07-12 15:09
为什么随着read延长，测序错误率呈现升高趋势？read2错误率要普...
测序时每个循环在荧光基团淬灭，去3’端保护基团时，去除不彻底，导致在延伸过程滞留，或者是加入了无3’端保护的碱基，导致延伸超前，滞留和超前造成延伸步调不同，随着循环增加，超前或滞后的累积增多，测序错误率也就随之增高；另一方面，随着测序时间延长，酶活性及试剂的有效性都会降低，因为测序是先测read1，后测read2...
回答于 2019-07-04 20:01
为什么read1和read2前几个碱基的错误率较高？
这是因为随机引物扩增的偏好性导致的，随机引物扩增偏好使得前边一些碱基的碱基含量不平衡，因而在base-calling的时候算法不准确，导致了错误率高。
回答于 2019-07-04 19:52