红橙子
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可变剪接事件在三代测序中未检测到,而在二代测序中检测到了的原...

这是可能发生的,三代测序的数据量并没有达到饱和,可能会漏测或者对于低丰度的基因不能检测到,二代数据由于数据量达到饱和,因此能检测到更多转录本的信息和相对低丰度的基因。

回答于 2019-08-29 23:23

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全长转录组为什么要构建混合文库?

2017年2月PacBio试剂升级,加深零模波导孔深度,片段偏好性逐渐降低,提高大片段测序检出率,构建不筛选片段+大于4Kb片段的混合文库可以改善长转录本较多的物种,增加测序到长转录本的概率,数据量产出高且稳定。

回答于 2019-08-09 16:10

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全长转录组是否需要打断,拼接?

全长转录组是基于PacBio三代测序平台,无需打断拼接,直接获得包含5’,3’UTR,poly A tail的完整转录本,从而准确分析有参考基因组物种可变剪切及融合基因等结构信息,克服无参考基因组物种转录本拼接较短、信息不完整的难题。

回答于 2019-08-09 16:09

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蛋白质组中什么类型样品需要去除高丰度蛋白?我们采取什么策略去...

需要去除高丰度蛋白的常见样品包括血清、血浆和脑脊液等富含白蛋白和免疫球蛋白的样品,去除一般采用的去除高丰度蛋白试剂盒进行。

回答于 2019-08-09 16:05

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蛋白质组中采用何种蛋白酶进行蛋白酶解?

通常采用胰蛋白酶,并结合两步酶解法,酶解更充分;特殊样品会采取针对性的蛋白酶进行酶解

回答于 2019-08-09 16:02

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iTRAQ/TMT和Label-free技术都有哪些优缺点?

(1)定量准确性:iTRAQ/TMT的定量准确性和重现性要明显优于Label-free,Label-free的样本之间不能直接混合,导致定量的结果受到的影响因素多,因此定量结果的准确度较低;(2)鉴定通量:Label-free通量相对较高,而iTRAQ/TMT由于标记基团的影响,鉴定通量较label-free 低;(3)修饰组学:label-free定量,修饰肽段的富集...

回答于 2019-08-09 15:56

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我想问一下怎么利用别人发表的转录组文章里面的数据分析自己基因...

别人发论文提交的数据一般是原始数据,想要得到这个实验里某些基因的表达量信息只能重新分析,也就是把转录组流程再跑一遍,这样就得到基因表达量信息了,但是这仅是这些基因在人家实验条件下的表达情况,假如他的和你的材料,处理条件等都一样,你也可以当做自己的数据来用的,希望能帮到你!假如需要分析数据可以联系我们...

回答于 2019-07-23 20:32

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二代转录组测序reads与基因组比对后,没有相应的注释结果,我们...

新基因预测分析是将测序Reads比对至参考基因组,然后进行拼接,其中一些reads比对到基因间区并且能拼接出完整的开放阅读框,拼接出来的位于基因间区的这些基因即为新基因。预测得到的新基因再进行功能注释,因此注释结果与新基因的鉴定没有关系。

回答于 2019-07-18 09:46

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组内某个生物学重复样品与其它相关性不太好怎么办?对文章发表有...

样品间的相关性反应了样品间的相似情况,样品间的相似度越高,样品间的差异基因越少。生物学组内重复样品的相关系数应大于组间样品的相关系数。 转录组测序通常要求设置至少3个生物学重复样本,如果出现某个样品与组内其它样本相关性不好的情况,可将该样本剔除,再进行差异分析。后期再通过生物学验证手段进行生物学验证...

回答于 2019-07-18 09:43

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请问一下关于禾本科干旱胁迫相关的基因家族有哪些,有没有参考文...

这个你去查文献吧   最基本的技能  不要太懒

回答于 2019-07-18 09:38