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同源四倍体可以用purge_dup去冗余吗
去冗余工具通常基于序列的相似性或重复单元的相似性来去除冗余序列。然而，在同源四倍体中，每个染色体组都包含相同的基因，因此它们之间的序列应该是相似的。因此，如果使用基于序列相似性的去冗余工具，可能会错误地去除一些染色体组，导致数据丢失或分析错误。 因此，对于同源四倍体，使用去冗余工具需要谨慎。在某些情...
回答于 2023-08-10 09:00
在做叶绿体组装时，出现了如下错误，该如何解决呢
这个错误信息的意思是“磁盘配额已超过”，系统尝试写入或创建的文件超过了你的磁盘空间限制。以后提问请说清哪个步骤，哪个代码？
回答于 2023-08-08 10:15
做pca分析，报错，提示row.names，这个是什么意思，要怎么解决
错误发生在读取文件 optsinput 时，原因应该是该文件中的行名（row.names）重复，你检查一下。
回答于 2023-08-05 11:51
没有基因组数据，如何得到基因上游的启动子序列数据，比如用转录...
首先要清楚概念，启动子是位于转录起始点前的DNA序列上的一段序列，主要集中在转录组起始点前2000bp区域，所以转录组中理论上是不存在启动子区域的，因为这部分序列不转录。
回答于 2023-08-04 15:31
在群体遗传学的分析中，通常会计算核苷酸多样性。一般是以滑动窗...
整体核苷酸多样性（pi值）可以通过计算整个基因组中的核苷酸变异率来获得。具体计算方法如下： 首先，将基因组序列分成若干个长度相同的的小窗口（滑动窗格）。 对于每个窗口，计算其中每个位点的核苷酸多样性（pi值）。 将所有窗口的pi值取平均值，得到整体pi值。 整体pi值反映了整个基因组中的核苷酸多样性水平，它...
回答于 2023-08-04 15:24
老师，你好，请问群体遗传学，用提供的代码计算LD，生成图时，为...
看报错信息，脚本在尝试读取名为 "ld.bin.bin" 的文件时报错，无法读取该文件中的数据行。您首先可以检查文件路径是否正确，并确保文件存在。然后，检查文件格式是否符合脚本的要求。如果文件格式正确但仍然无法读取，可能是文件已损坏或数据格式不正确，路径问题可能性较大。
回答于 2023-08-04 12:39
基因家族表达量热图的时候没有找到合适的FPKM文件
你做的A种，却用B种的转录组数据去看A种的家族成员的表达模式，这不合理吧？建议还是去找A种的转录组数据，或者自己测一下。
回答于 2023-08-03 15:20