红橙子
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顺式作用元件分析分析DNA还是RNA水平?分析时一般提取多长序列?

顺势作用元件是位于DNA上的,所以分析是在DNA水平进行的,一般提取基因起始密码子前1000-2000bp进行分析。

回答于 2019-05-18 16:59

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什么是顺式作用元件?

顺式作用元件(cis-acting element)是存在于基因旁侧序列中,能影响基因表达的一段DNA序列,它们的作用是参与基因表达的调控;顺式作用元件本身不编码任何蛋白质,仅仅提供一个作用位点,要与反式作用因子(多是转录组因子)相互作用而起作用。

回答于 2019-05-18 16:55

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有参转录组结果中的geneID是转录组本的ID吗?

不是,有参转录组中的geneID即是所参考基因组中的基因ID,可以在相应的基因组下载网站下载该物种基因组的GFF文件,然后根据GFF注释信息里的基因ID找到对应的转录本ID信息。

回答于 2019-05-09 22:16

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假基因都是没有功能的基因吗?

假基因:或称为伪基因,他是基因家族在进化过程中形成的无功能的残留物。与正常基因相似,但丧失正常功能的DNA序列,往往存在于真核生物的多基因家族中,般情况都不被转录,且没有明确生理意义。但假基因也可能是有功能的,其可能以类似非编码RNA的形式起到调控作用;假基因RNA的功能:1. 假基因的反义RNA与真(母)基因(pa...

回答于 2019-05-09 22:06

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如何扩增两个同源性极高的基因?

同源高的基因一般在3端UTR或5端UTR会有较大的差别,可以通过在两端的UTR中设计引物拉出目的基因。另一种方法是:分析家族内基因中的酶切位点,假如有某特异性酶切位点,这样可以通过酶切克隆片段,来判断哪一个是你的目的基因,再测序。

回答于 2019-04-29 21:57

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我要扩一个基因家族中的一个基因,但家族内基因同源性高,扩增出的...

同源高的基因一般在3端UTR或5端UTR会有较大的差别,可以通过在两端的UTR中设计引物拉出目的基因。另一种方法是:分析家族内基因中的酶切位点,假如有某特异性酶切位点,这样可以通过酶切克隆片段,来判断哪一个是你的目的基因,再测序。

回答于 2019-04-29 20:54

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原核mRNA与真核mRNA在结构上有什么不同?

原核生物( 包括病毒) 的mRNA 多是多顺反子,即可以有几个基因同时被转录成一个mRNA,共同使用一个启动调控区,而真核生物多是单顺反子,即一次只转录出一个基因;原核生物mRNA与真核不同,无5′端帽子结构和3′端聚腺苷酸尾巴。

回答于 2019-04-29 19:53

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什么是假基因?

假基因也叫伪基因,他是基因家族在进化过程中形成的无功能的残留物。它与正常基因相似,但丧失正常功能的DNA序列,往往存在于真核生物的多基因家族中,一般情况都不被转录,且没有明确生理意义。

回答于 2019-04-29 18:52

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根据转录组数据克隆功能基因

hsp70应该是一个基因家族,可根据该家族基因保守结构域blast转录组序列,转录组数据里是有预测的cds序列的,可以用里面的序列。

回答于 2019-04-29 18:41

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做基因家族成员鉴定时,如何从NCBI数据库里下载转录组unigene的...

下载方法参见文章:https://www.omicsclass.com/article/336,上有详细操作展示。

回答于 2019-04-29 18:35