不支持三组之间比较,只支持两组之间比较; 如果要三组以上比较建议用lefse分析;
回答于 2024-02-07 10:37
-M一般都是加上的: mark shorter split hits as secondary 兼容reads比对有剪切的情况;
回答于 2024-02-07 10:35
我们这个是按照ANNOVAR软件官方推荐构建的库; 如果出现大量错误,应该是你的vcf用的基因组版本和ANNOVAR库基因组版本不匹配造成的,你检查你的数据核实一下; ANNOVAR前移动一位是正常现象,GFF基因组碱基索引是从1开始,ANNOVAR 基因组碱基索引是从0开始;
回答于 2024-02-02 16:26
Beta多样性分析PCOA/NMDS分析无差异 这个肉眼看看的比较主观吧
回答于 2024-02-01 13:11
检查检查你群体里面的样本吧,样本遗传背景差异太大,不属于一个群体有可能导致这样的问题 或者群体数量太少,建议至少10个个体以上吧;
回答于 2024-01-30 12:03
进化树的枝可以旋转,你可以到iTOL网站调整自己的进化树结构; 如果还是不理想,建议你重新构建更好更符合自己预期的进化树:https://www.omicsclass.com/article/2010
回答于 2024-01-30 12:01