的确差异挺大的;; 看看这几个样本测序配置文件有没有搞错;合并双端数据看看read1 read2 overlap参数放低看看: Usage: qiime vsearch merge-pairs [OPTIONS] Merge paired-end sequence reads using vsearch's merge_pairs function. See the vsearch documentation for details on how paired-end merging is pe...
回答于 2024-01-29 13:12
还有GFF格式问题,这里的逗号和双引号应该删除,你对比课程里面正常的GFF文件格式; 看看是不是内存不够:https://www.omicsclass.com/question/6544
回答于 2024-01-28 20:34
可能是marker差异基因没找到,你换个方法: 比如 wilcox,降低阈值等再试试;
回答于 2024-01-28 15:12
注意冒号: 我们的课程已经更新qiime2最新了,了解一下:https://www.omicsclass.com/article/2371
回答于 2024-01-28 15:08
对的,命令行都是这样,命令行窗口下鼠标只有复制粘贴功能,需要移动光标可以按键盘上的方向键;
回答于 2024-01-28 15:07
需要自己下载对应种子的fastq文件,不用组装拼接,比对基因组上就行; 之后得到vcf文件就可以做GWAS了: 推荐课程:https://bdtcd.xetslk.com/s/RCGWQ
回答于 2024-01-28 15:06
电脑内存不够killed任务,你需要增加电脑内存: 内存设置见这里:https://www.omicsclass.com/article/1413
回答于 2024-01-28 15:03