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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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微生物16S分析时候,两端测序数据拼接

的确差异挺大的;; 看看这几个样本测序配置文件有没有搞错;合并双端数据看看read1 read2 overlap参数放低看看: Usage: qiime vsearch merge-pairs [OPTIONS]  Merge paired-end sequence reads using vsearch's merge_pairs function. See  the vsearch documentation for details on how paired-end merging is  pe...

回答于 2024-01-29 13:12

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请问老师如何看选择清除分析中的选择信号值?怎么判断受选择基因...

看基因附近的Fst值和pi值高低,局部的结果显示一下

回答于 2024-01-28 20:37

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提取CDS序列失败!!!

还有GFF格式问题,这里的逗号和双引号应该删除,你对比课程里面正常的GFF文件格式; 看看是不是内存不够:https://www.omicsclass.com/question/6544

回答于 2024-01-28 20:34

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wgd解析运行不了??

请按照视频课程中的操作启动相应的镜像,到docker容器里面分析数据,服务器上默认有些软件没有安装;

回答于 2024-01-28 15:13

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单细胞测序分析时快速找出所有细胞类型的差异/Marker基因,执行...

可能是marker差异基因没找到,你换个方法: 比如 wilcox,降低阈值等再试试;

回答于 2024-01-28 15:12

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老师您好,请问我mac电脑如何启动镜像

注意冒号: 我们的课程已经更新qiime2最新了,了解一下:https://www.omicsclass.com/article/2371

回答于 2024-01-28 15:08

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PowerShell 为什么在输入的字母都只能在后边,中间想键入都键入...

对的,命令行都是这样,命令行窗口下鼠标只有复制粘贴功能,需要移动光标可以按键盘上的方向键;

回答于 2024-01-28 15:07

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我现在有公共数据库其中500+种子,自己测了这种品种的一些表型...

需要自己下载对应种子的fastq文件,不用组装拼接,比对基因组上就行; 之后得到vcf文件就可以做GWAS了: 推荐课程:https://bdtcd.xetslk.com/s/RCGWQ

回答于 2024-01-28 15:06

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保留蛋白编码基因一直错误!!!

电脑内存不够killed任务,你需要增加电脑内存: 内存设置见这里:https://www.omicsclass.com/article/1413

回答于 2024-01-28 15:03

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单细胞测序分析时快速找出所有细胞类型的差异/Marker基因,执行...

可能是marker差异基因没找到,你换个方法:DESeq2 ,降低阈值等再试试;

回答于 2024-01-28 14:59