omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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进行基因注释过程中运行这个脚本perl $scriptsdir/pasa_extract_... 已采纳

所有的输入文件路经你确认一下看看有没有问题；

回答于 2024-01-27 10:04

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可以设置这个参数--group.by，默认是 metadata文件里面的cluster列细胞分类类型，你看看你的metadata文件设置一下这个参数：--group.by

回答于 2024-01-27 10:02

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服务器登录时有个服务器使用手册，你看看的再有也有个docker安装使用课程你可以看看：https://bdtcd.xetslk.com/s/3Rcvt0 docker基础文档：https://www.omicsclass.com/article/1181 再有，注意区分容器ID和镜像ID；

回答于 2024-01-27 09:54

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你在容器里面，free -h 看看内存够不够；

回答于 2024-01-27 09:51

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看看报错信息在这个nohup.out 文件里面：

回答于 2024-01-27 09:48

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输入文件都没错，那就是关联区域里面没有基因；

回答于 2024-01-25 09:24

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这个脚本在我们的docker基因家族镜像里面你拷贝出来就行：https://www.omicsclass.com/article/2307

回答于 2024-01-25 09:23

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检查VCF文件是不是有问题吧，或者你这个是不是GVCF呢；

回答于 2024-01-25 09:22

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设置key列与网络里面的node ID不一致吧，你检查数据

回答于 2024-01-25 09:21

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课程资料也相应更新了：https://www.omicsclass.com/article/2286，所以你的脚本也需要重新下载更新才行；不然你还是用之前版本的镜像，v1.2 因为latest现在就是2.0 所以很快下载完成；

回答于 2024-01-23 16:16