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circos中热图部分画不出来

你的配置文件写错了吧,建议你看看官方的说明:http://circos.ca/documentation/tutorials/ 看看     HIGHLIGHTS 部分

回答于 2019-10-17 10:27

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circos作图时,热图那个圈出现问题,画不出来

参考一下别人是如何描述问题的:https://www.omicsclass.com/question/1280 这样我们才好帮你发现问题,解决问题;

回答于 2019-10-16 18:07

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但是string数据库里没有丹参这个物种怎么办

里面应该有模式动植物的互作网络,建议用你丹参的基因同源比对一下拟南芥的基因,看对应的拟南芥基因是否有互作关系,再映射到自己的基因上;

回答于 2019-10-16 18:04

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string只能预测已知蛋白的互作蛋白,不能看两组特定蛋白是否互作...

一个物种的所有蛋白互作关系都在数据库里面,你想得到特定的,搜索一下对应的ID号就好了;

回答于 2019-10-16 10:26

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老师您好,我在做比较基因组学时遇到下面的问题是什么原因呢,我...

需要完全对应上才行,你再检查检查,或者截图我们看看ID; 还有就是bed里面列之间是否只有tab空白,如果有空格你删除一下;

回答于 2019-10-16 10:20

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有一个问题像请教一下大家,我用上课时老师给的脚本跑出来的tand...

这是软件mapchart绘图的原因,两个基因放在了一起。判断串联重复基因要用科学的方法才行:https://www.omicsclass.com/question/1

回答于 2019-10-15 12:04

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python版本mcscan出错

看看这个问题:https://www.omicsclass.com/question/1429/answer/1800 检查bed文件中的染色体ID与seqids文件中的ID是否一致

回答于 2019-10-15 11:51

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Linux安装anaconda后,加载镜像包,提示失败

linux基础不好,会遇到很多错误,建议学习了linux基础之后,对linux有一定了解之后再来尝试安装新的软件,不然会很费劲; linux系统使用  这门课建议学习一下。里面有conda的安装与操作演示:https://www.omicsclass.com/article/1159 以下命令为设置镜像之后再安装软件: conda config --add channels https://mirrors....

回答于 2019-10-15 11:06

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老师,您好,我有两组蛋白质,只有氨基酸序列(自己将其名命),...

可以提交到蛋白互作数据库STRING,做一下看看他们有没有互作关系;  https://string-db.org/

回答于 2019-10-15 10:59

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老师您好,我想请问一下,在做比较基因组学时,在这一步时,/bio...

模块名字写错了,你检查一下:jivi.compara.catalog

回答于 2019-10-15 10:55