你的配置文件写错了吧,建议你看看官方的说明:http://circos.ca/documentation/tutorials/ 看看 HIGHLIGHTS 部分
回答于 2019-10-17 10:27
参考一下别人是如何描述问题的:https://www.omicsclass.com/question/1280 这样我们才好帮你发现问题,解决问题;
回答于 2019-10-16 18:07
里面应该有模式动植物的互作网络,建议用你丹参的基因同源比对一下拟南芥的基因,看对应的拟南芥基因是否有互作关系,再映射到自己的基因上;
回答于 2019-10-16 18:04
一个物种的所有蛋白互作关系都在数据库里面,你想得到特定的,搜索一下对应的ID号就好了;
回答于 2019-10-16 10:26
需要完全对应上才行,你再检查检查,或者截图我们看看ID; 还有就是bed里面列之间是否只有tab空白,如果有空格你删除一下;
回答于 2019-10-16 10:20
这是软件mapchart绘图的原因,两个基因放在了一起。判断串联重复基因要用科学的方法才行:https://www.omicsclass.com/question/1
回答于 2019-10-15 12:04
看看这个问题:https://www.omicsclass.com/question/1429/answer/1800 检查bed文件中的染色体ID与seqids文件中的ID是否一致
回答于 2019-10-15 11:51
linux基础不好,会遇到很多错误,建议学习了linux基础之后,对linux有一定了解之后再来尝试安装新的软件,不然会很费劲; linux系统使用 这门课建议学习一下。里面有conda的安装与操作演示:https://www.omicsclass.com/article/1159 以下命令为设置镜像之后再安装软件: conda config --add channels https://mirrors....
回答于 2019-10-15 11:06
可以提交到蛋白互作数据库STRING,做一下看看他们有没有互作关系; https://string-db.org/
回答于 2019-10-15 10:59