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不同物种共线性分析时,出现以下报错信息怎么解决呢?no such fi...

这个错误是文件路径不存在, /biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python  如果是这个路径不存在  说明你安装的biolinux不是我们组学大讲堂提供的,你从新下载安装我们百度云盘里面的biolinux就可以:https://www.omicsclass.com/article/526

回答于 2019-09-23 15:27

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求问如何用R或者perl脚本来提取fromNode中包含某些ID的行?下图...

R语言和perl语言都可以做到,文件太大的话建议用perl语言; R语言用 %in%  可以做到,perl语言用hash就可以; perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高

回答于 2019-09-23 09:46

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Linu安装 返回 代码: E_INVALIDARG (0x80070057)

虚拟机文件ova文件下载不完整,重新下载安装一下:https://www.omicsclass.com/article/526

回答于 2019-09-20 15:41

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老师你好,我购买了“微生物OTU网络图绘制(Cytoscape)”,在sparcc...

会修改环境变量吗?  把这个文件的最后一行修改一下;   ~/.profile 用默认的python就可以了:

回答于 2019-09-20 11:32

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请问R/QTL这个包可以用来做果树群体的qtl定位吗?

可以分析,基因型分析可以做群体的重测序得到SNP按照不同的基因型进行分型; https://rqtl.org/  Rqtl 包做QTL定位,还有map QTL做定位的:https://www.kyazma.nl/index.php/MapQTL/

回答于 2019-09-20 09:52

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我下载了你们课程里的linux,可以用自己的电脑进行bwa基因组比对...

数据量太大的话,应该不可以,要么分析速度很慢,要么你的电脑吃不消,硬件达不到,存储内存等; 建议使用linux服务器分析高通量测序数据;

回答于 2019-09-20 09:48

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关于小麦基因家族中的同源性问题

染色体组之间做共线性分析,可以发现同源基因,具体可以参考文献:https://www.omicsclass.com/article/990 我们的基因家族分析课程里面有共线性分析视频建议学习:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读

回答于 2019-09-20 09:46

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请问进行基因组比对BWA软件如何安装

建议使用我们提供的biolinux虚拟机里面已经安装好了bwa,无需安装;https://www.omicsclass.com/article/526 安装方法: wget https://sourceforge.net/projects/bio-bwa/files/bwa-0.7.17.tar.bz2tar -jxvf bwa-0.7.17.tar.bz2cd bwa-0.7.17make  linux基础不好建议学习:linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析...

回答于 2019-09-19 17:43

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hisat2 reads 与基因组进行比对出错

命令报错了,没有运行成功,所以没有结果,检查命令行是否写错,记得这里应该用引号引起来; 转录组数据分析课程推荐: https://bdtcd.xetslk.com/s/29EigM

回答于 2019-09-19 15:26

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生信小白,想要从头学起,但不知道需要学习哪些课程?

生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高

回答于 2019-09-19 09:42