omicsgene
omicsgene - 生物信息
实名认证 专业认证

性别: 北京 - 北京市 注册于 2018-04-20

擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

生物信息

向TA求助
14482金币数
81870 经验值
447个粉丝
主页被访问 89066 次

4106 个回答

0 赞同

使用circos绘制彩图的时候,内部所有的线性关系都无法显示,怎么...

这里的染色体编号要一致:

回答于 2019-12-16 11:30

0 赞同

用ClustVis绘制热图出现的状况

看不出问题,应该是正常的吧

回答于 2019-12-16 11:29

0 赞同

hisat2建立index时的问题

GTF有问题,你需要整理一下,缺失gene_id

回答于 2019-12-16 11:28

0 赞同

我在利用GATK进行SNPcalling前对bam文件进行Markduplication时,...

信息都被抹掉了,怎么看出问题?

回答于 2019-12-16 11:26

0 赞同

McscanX做圈图时有缺口,怎么让它变成一个完整的圆?

这个绘制不好,建议有circos绘制圈图:https://www.omicsclass.com/article/644

回答于 2019-12-12 17:18

0 赞同

老师,只有FPKM的话,能用什么R包做差异分析啊?

如果是高通量测序的数据得到的FPKM表达量是不可以直接输入到R包里面做差异分析的,因为分析高通量数据差异基因的R包如edgeR ,DESeq2等都要求输入基因的count值。

回答于 2019-12-12 09:32

0 赞同

已知具体某个基因,是如何做共表达分析的

可以利用STRING数据库查询,该基因互作的蛋白网络:https://www.omicsclass.com/article/1126

回答于 2019-12-11 09:51

1 赞同

你好,我遇到了和你一样的问题,Circos could not find the conf...

路径写错了,差一个根目录: linux基础不好建议学习:linux系统使用

回答于 2019-12-11 09:36

0 赞同

老师您好,在基因家族分析中,进行共线性分析绘图时,一直出现一...

可以看看这个,染色体有问题:https://www.omicsclass.com/article/572   检查所有文件里面的染色体ID是否一致:https://www.omicsclass.com/question/1605

回答于 2019-12-10 15:52

0 赞同

做有参转录组分析,在进行基因表达定量的时候,出现如下问题,请...

上面已经有提示,你看看哪个基因是否缺少东西,检查一下

回答于 2019-12-10 15:44