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WGCNA安装问题
建议把R的版本更新到最新，3.6.1以上；然后重新安装WGCNA； R包安装技巧参考：https://www.omicsclass.com/article/106
回答于 2019-12-27 14:59
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共线性
MAD_box 里面是前面鉴定的基因家族基因列表 AT.collinearity 是拟南芥基因组的共线性关系 建议你再看看视频还有文献，理清分析思路。学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读
回答于 2019-12-27 14:56
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TCGA数据下载完成后，运行prepare代码进行数据整理时报错
看不到你运行的代码, 不好分析原因； 建议你把目录删除重新运行，有时候网络的原因有些文件下载不成功。
回答于 2019-12-26 17:31
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无参的转录组数据，能进行转录因子调控结合分析吗？
转录因子分析： 无参转录组转录因子基因都是注释的，至于转录因子与其他基因之间的调控关系，如果不做实验，那么都是前人的研究成果或者数据库中的调控关系：https://www.omicsclass.com/article/245 。 做实验研究：可以做蛋白免疫沉淀使用，也就是chip-seq；
回答于 2019-12-26 17:27
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你好！做基因家族分析，mcscan 做基因组间共线形关系，按课程做...
参考一下这个问题：https://www.omicsclass.com/article/572
回答于 2019-12-26 10:26
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bioconductor常用包 安装
digest 这个包是bioconductor上的包吗？ 你确认一下 我搜索是CRAN上的R包，不能用bioconductor安装 R包的安装方法见：https://www.omicsclass.com/article/106
回答于 2019-12-26 10:23
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