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4072 个回答

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McscanX做圈图时有缺口,怎么让它变成一个完整的圆?

这个绘制不好,建议有circos绘制圈图:https://www.omicsclass.com/article/644

回答于 2019-12-12 17:18

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老师,只有FPKM的话,能用什么R包做差异分析啊?

如果是高通量测序的数据得到的FPKM表达量是不可以直接输入到R包里面做差异分析的,因为分析高通量数据差异基因的R包如edgeR ,DESeq2等都要求输入基因的count值。

回答于 2019-12-12 09:32

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已知具体某个基因,是如何做共表达分析的

可以利用STRING数据库查询,该基因互作的蛋白网络:https://www.omicsclass.com/article/1126

回答于 2019-12-11 09:51

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你好,我遇到了和你一样的问题,Circos could not find the conf...

路径写错了,差一个根目录: linux基础不好建议学习:linux系统使用

回答于 2019-12-11 09:36

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老师您好,在基因家族分析中,进行共线性分析绘图时,一直出现一...

可以看看这个,染色体有问题:https://www.omicsclass.com/article/572   检查所有文件里面的染色体ID是否一致:https://www.omicsclass.com/question/1605

回答于 2019-12-10 15:52

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做有参转录组分析,在进行基因表达定量的时候,出现如下问题,请...

上面已经有提示,你看看哪个基因是否缺少东西,检查一下

回答于 2019-12-10 15:44

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老师,你好。在做有参转录组分析,准备的文件有基因组注释文件gt...

物种基因组注释不好的话,有可能比对率较低。再有检查一下建立的参考基因组索引是否正确,基因数量是否全。

回答于 2019-12-10 14:41

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我有一组数据想做个heapmapper热力图,您能帮我处理一下吗,我打...

具体热图绘制网站见:https://www.omicsclass.com/article/792

回答于 2019-12-10 14:18

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筛选两个结构域

可以换个hmm文件再搜索一次,得到的hmmer结果文件里面的基因取下交集就可以了;

回答于 2019-12-10 14:17

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PAML使用

这个分化时间,可以用kaks分析估算得到,基因家族分析课程里面有涉及这部分内容: 学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读

回答于 2019-12-10 14:16