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RNA-seq分析建立基因组index遇到问题

你说的硬盘,和内存没有关系;  hisat建立索引需要很多内存,报错信息也说明内存不够; 建立人类基因组索引3G,大概需要150G的内存,你看看你的应该增加物理内存;虚拟机做转录组分析比较困难。

回答于 2019-11-27 13:15

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MCScanX共线性分析出错,请问如何解决?

文件没有找到,命令行没有写完整吧,缺少文件,你检查一下;

回答于 2019-11-27 13:14

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启动子分析,使用get_promoter.pl提取上游序列时发生如下报错(...

是文件不存在的意思,你再看看英文意思: 标红的文件路径不对:

回答于 2019-11-26 17:33

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ITOL最近打不开

建议使用evolview美化进化树:https://www.omicsclass.com/article/671

回答于 2019-11-26 10:38

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MCSCANX共线性分析原理和串联重复分析

蛋白质和cds序列都可以;但是由于用mcscanX和blast方法去筛选可能导致结果不一致,结果任选其一就行;

回答于 2019-11-26 09:58

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请问blastp比对后再提取结构域,结果是空文件,这是怎么回事呢?

检查输入文件的ID是否对应;

回答于 2019-11-25 15:47

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/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.cat...

检查输入的所有文件是否有问题。 或者把输入文件都截图给我看看;

回答于 2019-11-25 15:47

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TBtools无法使用和更新

先把网络断开,再打开tbtools试试;

回答于 2019-11-25 15:44

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分化时间计算中的r值

突变速率每个物种都不一样

回答于 2019-11-25 15:44

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运行meme motif analysis时报错,无meme文件,locate也找不到bio...

安装我们提供的biolinux ova包,里面安装了一些分析软件:https://www.omicsclass.com/article/526

回答于 2019-11-24 15:56