GEO数据挖掘中遇见的问题

老师你好,

在学习GEO数据挖掘的课程中,在GO富集分析过程中,课程用的是人的基因注释R包:org.Hs.eg.db,请问做水稻用什么基因注释R包呢?我用拟南芥的R包org.At.tair.db总是出问题。谢谢!

请先 登录 后评论

1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

目前ordb支出的物种见:http://bioconductor.org/packages/release/BiocViews.html#___OrgDb

不同的物种之间不能混用,因为基因ID的对应关系不一致;


如果上面没有对应的物种,可以参考这个:https://www.omicsclass.com/article/302

请先 登录 后评论
  • 1 关注
  • 0 收藏,61 浏览
  • 提出于 2020-01-18 12:47

相似问题