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请教用gtf文件获取基因与mRNA的对应关系的问题
脚本要求输入gff格式的文件才可以正常运行，不要输入gtf格式的文件，会报错； 请 下载参考基因组里面对应的gff文件再运行此脚本。 另外，gff文件是可以转换成gtf文件，但是gtf文件无法转换成gff文件。
回答于 2020-01-09 11:12
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请教！基因结构分析出现这样的问题如何解决？
我看你的命令行输入的是拟南芥的GFF文件，但是截图是其他物种的，请确保自己的文件里面的信息来自于同一物种的一套参考基因组； 不同物种基因ID不一样，染色体也不一样，程序肯定会报错的；
回答于 2020-01-09 11:10
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在提取1500bp序列做顺式作用元件检测时，使用tiquxulie.pl这个脚...
建议你提高自己笔记本的内存，详细信息见：https://www.omicsclass.com/question/1231
回答于 2020-01-09 11:08
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比较基因组学构图（物种间共线性分析时），手动生成两个配置文件...
看看这个文件里面的染色体ID与bed，里面的染色体ID是否一致： 更多可见：https://www.omicsclass.com/question/1361
回答于 2020-01-08 13:43
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玉米单个基因与性状的分析
类似这样的文章，大麦开花基因（Ppd-H1）适应性遗传进化分析：https://academic.oup.com/mbe/article/25/10/2211/1031345
回答于 2020-01-06 13:07
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老师，您好。我用这个流程做另外一个基因家族，从ncbi下载下这些...
sra数据为测序数据的原始fastq数据，需要自己做转录组比对定量表达分析，建议实验室有计算机服务器才好分析： 转录组自主分析课程：二代测序转录组数据自主分析 自己分析比较困难，可以找我们组学生物分析。
回答于 2020-01-06 12:56
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