基因组中的SSR引物的设计,需要借助编程语言批量完成才行,perl语言高级编程课程里面有涉及,你可以学习一下: perl入门到精通、perl语言高级
回答于 2019-12-27 15:01
不同的网站 ID编号不一样吧,或者基因组的来源不一样,你需要去看看。 以一个数据库里面的ID为准就行。
回答于 2019-12-27 15:00
建议把R的版本更新到最新,3.6.1以上;然后重新安装WGCNA; R包安装技巧参考:https://www.omicsclass.com/article/106
回答于 2019-12-27 14:59
MAD_box 里面是前面鉴定的基因家族基因列表 AT.collinearity 是拟南芥基因组的共线性关系 建议你再看看视频还有文献,理清分析思路。学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读
回答于 2019-12-27 14:56
看不到你运行的代码, 不好分析原因; 建议你把目录删除重新运行,有时候网络的原因有些文件下载不成功。
回答于 2019-12-26 17:31
转录因子分析: 无参转录组转录因子基因都是注释的,至于转录因子与其他基因之间的调控关系,如果不做实验,那么都是前人的研究成果或者数据库中的调控关系:https://www.omicsclass.com/article/245 。 做实验研究:可以做蛋白免疫沉淀使用,也就是chip-seq;
回答于 2019-12-26 17:27