擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS
生物信息
那些太短的scaffold去除一下,太多染色体circos会报错;展示染色体就行
回答于 2024-04-19 17:56
输入的vcf文件格式问题吧,你检查输入文件看看有没有异常
回答于 2024-04-19 11:18
看看运行过程中最后有没有报错吧, 如果最后有killed字样就表示内存不够导致系统杀死了任务;
回答于 2024-04-19 11:09
数据质控,一般测序公司会给质控好的;
回答于 2024-04-18 18:34
我看命令行没有问题,可能你的电脑没有联网吧,你再试试的;
回答于 2024-04-18 18:33
可以的,你可以先把双端的用flash 软件合并成单端的,再和单端的合并一起用qiime2 导入分析
回答于 2024-04-18 18:29
理论上影响不大,因为引物也是扩增子的一部分, 但是如果你的引物有简并,最好还是去除一下;
回答于 2024-04-18 15:24
可以再检查看看的,可能你没看到吧;
回答于 2024-04-18 14:43
需要先建GO KEGG注释库,之后才可以做富集分析这里有非模式物种KEGG与GO富集分析课程你看看的:https://bdtcd.xetslk.com/s/29EigM
回答于 2024-04-17 23:12
有参数输入错误吧,你检查你的命令行:stagestage 分组列名写错了; 看不到你的命令行无法指出错误;
回答于 2024-04-17 23:10