我们的代码都是测试通过的,大部分报错都是文件格式问题,你仔细核对自己的数据和示例数据差别,确保列分隔符是tab键; windows里面记事本编辑过的文件很容易报错, 一定要注意编码格式,建议用notepad++等文本编辑工具编辑:https://www.omicsclass.com/article/395
回答于 2025-04-30 17:20
dockerhub 国内上不了,有购买我们课程可以联系客服处理:点击联系客服
回答于 2025-04-29 09:34
docker 加载镜像默认放在家目录下,你的家目录满了吧; df -h #查看存储
回答于 2025-04-29 09:30
看看这个问题:https://www.omicsclass.com/question/7704 cellchat的bug,你用数字代替细胞分组
回答于 2025-04-28 17:27
下面是手动修改列名的R代码,你自己可以运行修改一下: # 加载必要的包library(Seurat)library(dplyr)## 1. 创建示例Seurat对象(如果已有数据可跳过此步)# 使用Seurat内置数据集seurat_obj <- readRDS("subsetCD8.reanalysis.rds")# 查看原始metadata列名cat("原始metadata列名:\n")print(colnames(seurat_obj@meta.d...
回答于 2025-04-27 17:42
内置的 基因集数据库用的R包是这个:msigdbr 说明:https://igordot.github.io/msigdbr/articles/msigdbr-intro.html 常见基因集: gs_catgs_subcatnum_genesetsC1299C2CGP3384C2CP29C2CP:BIOCARTA292C2CP:KEGG186C2CP:PID196C2CP:REACTOME1615C2CP:WIKIPATHWAYS664C3MIR:MIRDB2377C3MIR:MIR_Legacy221C3TFT:GTRD518C3T...
回答于 2025-04-27 10:09