检查了示例文件,这地方的基因型有些特殊,不标准,导致beagle 报错: 运行下面的代码修改一下 zcat ../00.filter/clean.vcf.gz |sed 's#\t.:#\t./.:#g' |gzip - > clean.vcf.gz 新文件输入运行beagle beagle -Xmx4g -Djava.io.tmpdir=./ gt=clean.vcf.gz out=all.impute impute=true window=10 nthreads=2
回答于 2025-04-03 11:00
core dumped 可能是电脑系统软件编译问题,导致运行不了,建议换个电脑试试的; 或者到我们云服务器上分析数据;
回答于 2025-03-31 17:28
可行的,但是操作起来比较麻烦。建议自己从头构建吧 泛基因组构建有课程见:https://bdtcd.xetlk.com/s/lIqL9
回答于 2025-03-28 13:17