omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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单细胞测序cellranger分析

云服务器putty登陆的时候有个使用手册你看看的查看磁盘使用空间； cellranger 跑原始测序数据数据量大，确保磁盘空间足够才行。删除一些没用的数据； Rstudio卡住参考：https://www.omicsclass.com/article/2080

回答于 2025-11-10 17:31

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成纤维细胞分好的亚组添加到总的组中

R代码如下： library(dplyr)metadata <- metadata %>% left_join(fib_info, by = "cell_id") %>% mutate(celltype_fib = ifelse(celltype == "fib", fib_subtype, celltype))

回答于 2025-11-09 16:02

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单细胞转录组课程findallmarker中的KEGG和GO富集分析，对于不是...

非模式物种没有现成的GO和KEGG注释数据库，可以自己构建注释数据库做分析，可以看转录组课程里面有介绍：https://bdtcd.xetslk.com/s/29EigM

回答于 2025-11-07 17:30

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使用monocle2进行轨迹分析报错

这是由于igraph 版本高，导致 monocle2 与igraph版本冲突报错，这个问题需要更改 monocle2的源代码才能适应高版本的igraph。可以使用 5版本的镜像：single-cell-v5.0.tar.gz monocle2。并且已经更新绘制热图；代码已经更新：https://bdtcd.xetlk.com/s/4i88K6

回答于 2025-11-06 13:28

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