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Error running system command: </biosoft/annovar/2018Apr16/ta...
VCF文件没有格式问题，检查你的ANNOVAR的库是不是构建正确
回答于 2024-04-22 15:32
16S扩增子分析中聚类分析出现问题。
这个脚本有两个输入文件，你看看你的$metadata 文件，第50行是不是有问题； 如果在windows编辑文件，建议用专业的文本编辑器，避免windows和linux的兼容问题：https://www.omicsclass.com/article/395
回答于 2024-04-22 11:38
不同组扩增子数据长度差距太大，如果一起分析是不是结果不太好，...
不同批次的数据qiime2数据可以分开分析再合并： https://forum.qiime2.org/t/how-to-analyze-together-different-batches-of-samples/15524 https://docs.qiime2.org/2024.2/tutorials/fmt/ 如果长度差异太大建议：看看这个：https://forum.qiime2.org/t/merging-two-projects-with-different-raw-file-types-to-perfo...
回答于 2024-04-22 10:50
LDdecay衰减距离如何确定？
LD衰减距离是R2最大值与最小值中间的值对应的距离就是平均衰减距离；课程里面有讲的：https://bdtcd.xetslk.com/s/3QzQFb 不平滑和你的群体数据有关系，个体差异数量等；
回答于 2024-04-22 09:14
plink怎么设置样本的PPID，MID，Sex信息？
这个你查一下plink的文件格式帮助信息：https://www.cog-genomics.org/plink/1.9/formats
回答于 2024-04-22 09:10
tassel跑glm模型报错et.maizegenetics.pipeline.TasselPipeline...
可能是你的软件安装问题吧，可以拿我们的测试数据测试一下软件； 建议你你用我们的docker镜像吧，我们的软件安装都测试过的； 再就是看看文件有没有异常吧；
回答于 2024-04-19 18:01
ParaAT 多序列比对 报错 2.0
这个需要测试查看你的输入文件是不有问题；光从你的描述我也不好推断原因； 这些异常的基因都去看看删除一下试试，还有就是文件不要在windows下用记事本修改导致文件兼容问题；编辑用专业的工具并设置：https://www.omicsclass.com/article/395
回答于 2024-04-19 17:59