2 解决

3 MCSCANX共线性分析原理和串联重复分析

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3 如果用blastp来找到的基因家住成员D或从已发表的文献中已获知家族成员ID，得到了家族成员列表，后续的基因家族分析中都再用WRKY_domain_new_out_removed_redundant.txt,而不用confirmed_IDlist.txt。我用了一下后者，后续文件提取不成功。如果只有家族成员ID，没有hmmsearch的输出文件，后续的基因家族分析怎么做

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3 为什么预测基因家族顺势原件位置信息出来是空表

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3 Failed to open tabular per-dom output file zf-C2H2.txt for writing怎么解决

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20 老师你好，blast分析串联重复基因结果文件duplication_gene.out与MCScanX 结果文件 tandem的串联重复基因不一致怎么解释？

  • 2019-10-21 15:38
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20 在利用脚本得到重复基因的时候出现了报错open failed

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20 有一个问题像请教一下大家，我用上课时老师给的脚本跑出来的tandem pair有两对，但是做基因定位染色体图时发现了更多的连在一起的重复基因，那么是我脚本没弄对还是基因定位染色体给到的串联重复不正确？

  • 2019-10-15 12:03
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3 python版本mcscan出错

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5 我在运行MCScanX时报错，以下是我的输入文件和报错截图

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3 老师你好，我想问信息检索的问题，同样查询NBS蛋白序列，想用他俩的NBS序列与拟南芥的NBS序列做blastp。搜索页面出现的关键字不一样？他们有什么关系吗？我该怎么下载？谢谢老师。

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5 基因组立调出来序列与NCBI上下载序列有差别

  • ollo 2019-09-12 20:44
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5 两个物种circos

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5 保守结构域

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5 mRNA和gene ID不一致如何进行修改

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5 基因家族

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5 我构建了Di19基因家族成员的圆形的进化树，里面包括拟南芥、玉米、水稻和甘蔗的，之后该如何进行亚群分类，查过之前的文献没有找到

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5 美化进化树输入Group分组指令点击Submit没有报错能正常运行，但是进化树上不显示分组标识，请问是什么原因

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5 geneid_to_mRNAid.pl

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5 安装circos时，模块显示有问题

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5 为什么蜈蚣图画出来是这样样子？我的配置文件感觉没有问题。