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5 mcscan_layout参数都是有关什么呢？求教

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10 在运用Linux系统命令，KA/KS，计算重复串联基因时，出现的duplication_gene文件，有点问题

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5 想要用evolview美化进化树，可是newiek格式的进化树一直传不上去，这是为什么？哪位老师知道，求助！

  • 2020-02-07 17:14
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20 请教用gtf文件获取基因与mRNA的对应关系的问题

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5 基因家族分析时，顺式作用元件提取只能提取列表中的一部分基因，请问是什么原因

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5 进化树boostrap值过滤

  • 2019-12-24 16:53
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5 染色体位置，导出之后是空文件

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3 MCSCANX共线性分析原理和串联重复分析

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3 如果用blastp来找到的基因家住成员D或从已发表的文献中已获知家族成员ID，得到了家族成员列表，后续的基因家族分析中都再用WRKY_domain_new_out_removed_redundant.txt,而不用confirmed_IDlist.txt。我用了一下后者，后续文件提取不成功。如果只有家族成员ID，没有hmmsearch的输出文件，后续的基因家族分析怎么做

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3 为什么预测基因家族顺势原件位置信息出来是空表

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3 Failed to open tabular per-dom output file zf-C2H2.txt for writing怎么解决

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20 老师你好，blast分析串联重复基因结果文件duplication_gene.out与MCScanX 结果文件 tandem的串联重复基因不一致怎么解释？

  • 2019-10-21 15:38
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20 在利用脚本得到重复基因的时候出现了报错open failed

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20 有一个问题像请教一下大家，我用上课时老师给的脚本跑出来的tandem pair有两对，但是做基因定位染色体图时发现了更多的连在一起的重复基因，那么是我脚本没弄对还是基因定位染色体给到的串联重复不正确？

  • 2019-10-15 12:03
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3 python版本mcscan出错

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5 我在运行MCScanX时报错，以下是我的输入文件和报错截图

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3 老师你好，我想问信息检索的问题，同样查询NBS蛋白序列，想用他俩的NBS序列与拟南芥的NBS序列做blastp。搜索页面出现的关键字不一样？他们有什么关系吗？我该怎么下载？谢谢老师。

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5 基因组立调出来序列与NCBI上下载序列有差别

  • ollo 2019-09-12 20:44
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5 两个物种circos

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5 保守结构域